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Orthologous genes in OrthoFinder**

Species Gene Description
 ghi-r.1  107921087  DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 5 

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Top 50 coexpressed genes to 107921087 (ghi-r.1 coexpression data)

 KEGG ID   Pathway name   #genes in coex list   #genes in genome   -log10(p)   Link to the KEGG* map 
(Multiple genes)

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Top 50 enrichment test to 107921087 (ghi-r.1 coexpression data)

CoexMap"107921087"


ghiLOC107921087 | Entrez gene ID : 107921087
Species ghi tae mtr osa zma bdi vvi sbi ppo bna sly nta cre sot hvu ath gma cit bra
Paralog 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
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CoexMap
Chloroplast
Nucleus

functional annotation
KEGG
GO BP
GO:0006364 [list] [network] rRNA processing  (477 genes)  IEA  
GO CC
GO:0005730 [list] [network] nucleolus  (469 genes)  IEA  
GO MF
GO:0003724 [list] [network] RNA helicase activity  (165 genes)  IEA  
GO:0003723 [list] [network] RNA binding  (3053 genes)  IEA  
Protein XP_016706440.1 [sequence] [blastp]
XP_016706441.1 [sequence] [blastp]
XP_040942424.1 [sequence] [blastp]
XP_040942425.1 [sequence] [blastp]
XP_040942426.1 [sequence] [blastp]
XP_040942427.1 [sequence] [blastp]
XP_040942428.1 [sequence] [blastp]
XP_040942430.1 [sequence] [blastp]
XP_040942431.1 [sequence] [blastp]
XP_040942432.1 [sequence] [blastp]
XP_040942433.1 [sequence] [blastp]
XP_040942434.1 [sequence] [blastp]
XP_040942435.1 [sequence] [blastp]
XP_040942436.1 [sequence] [blastp]
Subcellular
localization
wolf
cyto 3,  extr 2,  cyto_E.R. 2,  chlo 1,  mito 1,  E.R. 1,  cyto_nucl 1,  chlo_mito 1,  cyto_pero 1,  cyto_plas 1  (predict for XP_016706440.1)
cyto 8,  nucl 1,  cysk_nucl 1  (predict for XP_016706441.1)
cyto 3,  extr 2,  cyto_E.R. 2,  chlo 1,  mito 1,  E.R. 1,  cyto_nucl 1,  chlo_mito 1,  cyto_pero 1,  cyto_plas 1  (predict for XP_040942424.1)
cyto 3,  extr 2,  cyto_E.R. 2,  chlo 1,  mito 1,  E.R. 1,  cyto_nucl 1,  chlo_mito 1,  cyto_pero 1,  cyto_plas 1  (predict for XP_040942425.1)
cyto 3,  extr 2,  cyto_E.R. 2,  chlo 1,  mito 1,  E.R. 1,  cyto_nucl 1,  chlo_mito 1,  cyto_pero 1,  cyto_plas 1  (predict for XP_040942426.1)
cyto 3,  extr 2,  cyto_E.R. 2,  chlo 1,  mito 1,  E.R. 1,  cyto_nucl 1,  chlo_mito 1,  cyto_pero 1,  cyto_plas 1  (predict for XP_040942427.1)
cyto 3,  extr 2,  cyto_E.R. 2,  chlo 1,  mito 1,  E.R. 1,  cyto_nucl 1,  chlo_mito 1,  cyto_pero 1,  cyto_plas 1  (predict for XP_040942428.1)
cyto 8,  nucl 1,  cysk_nucl 1  (predict for XP_040942430.1)
cyto 8,  nucl 1,  cysk_nucl 1  (predict for XP_040942431.1)
cyto 8,  nucl 1,  cysk_nucl 1  (predict for XP_040942432.1)
cyto 8,  nucl 1,  cysk_nucl 1  (predict for XP_040942433.1)
cyto 8,  nucl 1,  cysk_nucl 1  (predict for XP_040942434.1)
cyto 8,  nucl 1,  cysk_nucl 1  (predict for XP_040942435.1)
cyto 8,  nucl 1,  cysk_nucl 1  (predict for XP_040942436.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 7,  mito 3  (predict for XP_016706440.1)
other 6  (predict for XP_016706441.1)
other 7,  mito 3  (predict for XP_040942424.1)
other 7,  mito 3  (predict for XP_040942425.1)
other 7,  mito 3  (predict for XP_040942426.1)
other 7,  mito 3  (predict for XP_040942427.1)
other 7,  mito 3  (predict for XP_040942428.1)
other 6  (predict for XP_040942430.1)
other 6  (predict for XP_040942431.1)
other 6  (predict for XP_040942432.1)
other 6  (predict for XP_040942433.1)
other 6  (predict for XP_040942434.1)
other 6  (predict for XP_040942435.1)
other 6  (predict for XP_040942436.1)
Gene expression
All samples [Expression pattern]
Tissue specificity*
Show Coexpressed Genes
Gene Function KEGG Entrez
Gene
ID
Other ID Link Target

ghi-r.1
for
107921087

.


Ortholog ID: 24095
Species ghi ghi
Symbol LOC107891992 LOC121218428
Function* uncharacterized LOC107891992 uncharacterized LOC121218428
Coexmap

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Coexpression

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KEGG Info
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
ghi03082 ATP-dependent chromatin remodeling 3
Expression Expression pattern Expression pattern
Entrez Gene ID* 107891992 121218428
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