Select Species**


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Orthologous genes in OrthoFinder**

Species Gene Description
 ppo-u.5   18098570   pentatricopeptide repeat-containing protein At5g66520 
 ppo-r.4   18098570   pentatricopeptide repeat-containing protein At5g66520 
 vvi-u.5   100247691   pentatricopeptide repeat-containing protein At5g48910 

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Top 50 coexpressed genes to 18098570 (ppo-u.5 coexpression data)

 KEGG ID   Pathway name   #genes in coex list   #genes in genome   -log10(p)   Link to the KEGG* map 
(Multiple genes)

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Top 50 enrichment test to 18098570 (ppo-u.5 coexpression data)

CoexMap"18098570"


ppoLOC18098570 | Entrez gene ID : 18098570    
Species ppo vvi sly osa zma bna ghi gma sbi nta mtr cre bra cit hvu bdi sot tae ath
Paralog 2 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
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CoexMap
Chloroplast
Nucleus

functional annotation
KEGG
GO BP
GO:0009451 [list] [network] RNA modification  (384 genes)  IEA  
GO CC
GO MF
GO:0008270 [list] [network] zinc ion binding  (777 genes)  IEA  
GO:0003723 [list] [network] RNA binding  (1480 genes)  IEA  
GO:0005515 [list] [network] protein binding  (4916 genes)  IEA  
Protein XP_024457564.2 [sequence] [blastp]
XP_052309110.1 [sequence] [blastp]
XP_052309111.1 [sequence] [blastp]
XP_052309112.1 [sequence] [blastp]
XP_052309113.1 [sequence] [blastp]
XP_052309114.1 [sequence] [blastp]
XP_052309115.1 [sequence] [blastp]
XP_052309116.1 [sequence] [blastp]
XP_052309117.1 [sequence] [blastp]
XP_052309118.1 [sequence] [blastp]
XP_052309119.1 [sequence] [blastp]
XP_052309120.1 [sequence] [blastp]
XP_052309121.1 [sequence] [blastp]
XP_052309122.1 [sequence] [blastp]
XP_052309123.1 [sequence] [blastp]
Subcellular
localization
wolf
cyto 6,  nucl 1,  mito 1,  plas 1,  pero 1,  chlo_mito 1,  cyto_mito 1,  cysk_nucl 1  (predict for XP_024457564.2)
cyto 6,  nucl 1,  mito 1,  plas 1,  pero 1,  chlo_mito 1,  cyto_mito 1,  cysk_nucl 1  (predict for XP_052309110.1)
cyto 6,  nucl 1,  mito 1,  plas 1,  pero 1,  chlo_mito 1,  cyto_mito 1,  cysk_nucl 1  (predict for XP_052309111.1)
cyto 6,  nucl 1,  mito 1,  plas 1,  pero 1,  chlo_mito 1,  cyto_mito 1,  cysk_nucl 1  (predict for XP_052309112.1)
cyto 6,  nucl 1,  mito 1,  plas 1,  pero 1,  chlo_mito 1,  cyto_mito 1,  cysk_nucl 1  (predict for XP_052309113.1)
cyto 6,  nucl 1,  mito 1,  plas 1,  pero 1,  chlo_mito 1,  cyto_mito 1,  cysk_nucl 1  (predict for XP_052309114.1)
cyto 6,  nucl 1,  mito 1,  plas 1,  pero 1,  chlo_mito 1,  cyto_mito 1,  cysk_nucl 1  (predict for XP_052309115.1)
cyto 6,  nucl 1,  mito 1,  plas 1,  pero 1,  chlo_mito 1,  cyto_mito 1,  cysk_nucl 1  (predict for XP_052309116.1)
cyto 6,  nucl 1,  mito 1,  plas 1,  pero 1,  chlo_mito 1,  cyto_mito 1,  cysk_nucl 1  (predict for XP_052309117.1)
cyto 6,  nucl 1,  mito 1,  plas 1,  pero 1,  chlo_mito 1,  cyto_mito 1,  cysk_nucl 1  (predict for XP_052309118.1)
cyto 6,  nucl 1,  mito 1,  plas 1,  pero 1,  chlo_mito 1,  cyto_mito 1,  cysk_nucl 1  (predict for XP_052309119.1)
cyto 6,  nucl 1,  mito 1,  plas 1,  pero 1,  chlo_mito 1,  cyto_mito 1,  cysk_nucl 1  (predict for XP_052309120.1)
cyto 6,  nucl 1,  mito 1,  plas 1,  pero 1,  chlo_mito 1,  cyto_mito 1,  cysk_nucl 1  (predict for XP_052309121.1)
cyto 6,  nucl 1,  mito 1,  plas 1,  pero 1,  chlo_mito 1,  cyto_mito 1,  cysk_nucl 1  (predict for XP_052309122.1)
cyto 6,  nucl 1,  mito 1,  plas 1,  pero 1,  chlo_mito 1,  cyto_mito 1,  cysk_nucl 1  (predict for XP_052309123.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 6,  chlo 3  (predict for XP_024457564.2)
other 6,  chlo 3  (predict for XP_052309110.1)
other 6,  chlo 3  (predict for XP_052309111.1)
other 6,  chlo 3  (predict for XP_052309112.1)
other 6,  chlo 3  (predict for XP_052309113.1)
other 6,  chlo 3  (predict for XP_052309114.1)
other 6,  chlo 3  (predict for XP_052309115.1)
other 6,  chlo 3  (predict for XP_052309116.1)
other 6,  chlo 3  (predict for XP_052309117.1)
other 6,  chlo 3  (predict for XP_052309118.1)
other 6,  chlo 3  (predict for XP_052309119.1)
other 6,  chlo 3  (predict for XP_052309120.1)
other 6,  chlo 3  (predict for XP_052309121.1)
other 6,  chlo 3  (predict for XP_052309122.1)
other 6,  chlo 3  (predict for XP_052309123.1)
Gene expression
All samples [Expression pattern]
Tissue specificity*
Show Coexpressed Genes
Gene Function KEGG Entrez
Gene
ID		 Other ID Link Target Reference

ppo-u.5
for
18098570

.
ppo-r.4
for
18098570

.
vvi-u.5
for
100247691

.


Ortholog ID: 23890
Species vvi ppo
Symbol LOC100247691 LOC18098570
Function* pentatricopeptide repeat-containing protein At5g48910 pentatricopeptide repeat-containing protein At5g66520
Coexmap

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Coexpression

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KEGG Info
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
vvi03010 Ribosome 2
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
ppo04626 Plant-pathogen interaction 2
ppo00630 Glyoxylate and dicarboxylate metabolism 2
ppo01230 Biosynthesis of amino acids 2
ppo00710 Carbon fixation by Calvin cycle 2
ppo01200 Carbon metabolism 2
Expression Expression pattern Expression pattern
Entrez Gene ID* 100247691 18098570
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