[][] vvi   VIT_00027800001 Gene
functional annotation
Function   serine/threonine-protein phosphatase PP1 isozyme 3
GO BP
GO CC
GO MF
KEGG vvi03015 [list] [network] mRNA surveillance pathway (110 genes)
Protein XP_002285139.1  XP_010650083.1 
BLAST XP_002285139.1  XP_010650083.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC542269 (zma)TOPP1 (ath)TOPP4 (ath)TOPP9 (ath)TOPP5 (ath)TOPP7 (ath)TOPP8 (ath)TOPP6 (ath)TOPP2 (ath)TOPP3 (ath)LOC4326473 (osa)LOC4331166 (osa)LOC4332369 (osa)LOC4340228 (osa)LOC7458113 (ppo)LOC7478936 (ppo)LOC7479289 (ppo)LOC7487983 (ppo)LOC11406064 (mtr)LOC11413712 (mtr)LOC11419847 (mtr)LOC11424441 (mtr)LOC11425683 (mtr)LOC11431740 (mtr)LOC11432243 (mtr)LOC25502117 (mtr)LOC100191199 (zma)LOC100216757 (zma)LOC100217163 (zma)LOC100240815 (vvi)LOC100250219 (vvi)LOC100256994 (vvi)LOC100258649 (vvi)LOC100259840 (vvi)LOC100263930 (vvi)LOC100272981 (zma)LOC100282306 (zma)LOC100283013 (zma)LOC100284227 (zma)LOC100780047 (gma)LOC100783178 (gma)LOC100790490 (gma)LOC100791655 (gma)LOC100799218 (gma)LOC100804212 (gma)LOC100805030 (gma)LOC100807069 (gma)LOC100808597 (gma)LOC100811593 (gma)LOC100816262 (gma)LOC101243716 (sly)LOC101249363 (sly)LOC101249463 (sly)LOC101251329 (sly)LOC101254698 (sly)LOC101258308 (sly)LOC101260053 (sly)LOC103634267 (zma)LOC103635487 (zma)LOC103827974 (bra)LOC103833886 (bra)LOC103838234 (bra)LOC103845343 (bra)LOC103849914 (bra)LOC103851601 (bra)LOC103854676 (bra)LOC103856650 (bra)LOC103857886 (bra)LOC103858272 (bra)LOC103858598 (bra)LOC103859101 (bra)LOC103868042 (bra)LOC103870808 (bra)LOC103873291 (bra)LOC103874509 (bra)
Subcellular
localization
wolf
cyto 4,  nucl 1,  cysk 1,  cysk_nucl 1,  plas 1,  E.R. 1,  pero 1,  golg 1,  golg_plas 1,  E.R._plas 1  (predict for XP_002285139.1)
cyto 4,  nucl 1,  cysk 1,  cysk_nucl 1,  chlo 1,  mito 1,  plas 1,  E.R. 1,  chlo_mito 1,  E.R._plas 1,  mito_plas 1  (predict for XP_010650083.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 7  (predict for XP_002285139.1)
other 7  (predict for XP_010650083.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
vvi03015 mRNA surveillance pathway 2
Genes directly connected with LOC100240794 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail
Entrez Gene ID*
6.6 LOC100241629 probable anion transporter 4, chloroplastic [detail] 100241629
5.1 LOC100251654 UNC93-like protein 3 [detail] 100251654
4.5 LOC100240797 F-box/LRR-repeat protein At1g67190 [detail] 100240797
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for LOC100240794]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 100240794    
Refseq ID (protein) XP_002285139.1 
XP_010650083.1 


The preparation time of this page was 0.2 [sec].