[←][→] vvi   VIT_00017142001 Gene
functional annotation
Function   probable disease resistance protein At1g12280  
GO BP
GO CC
GO MF
KEGG vvi04626 [list] [network] Plant-pathogen interaction (242 genes)
Protein XP_010654915.1 
BLAST XP_010654915.1 
Orthologous [Ortholog page] AT3G15700 (ath)  AT4G10780 (ath)  RPS2 (ath)  AT5G05400 (ath)  AT5G43730 (ath)  AT5G43740 (ath)  AT5G47250 (ath)  AT5G47260 (ath)  AT5G63020 (ath)  RFL1 (ath)  RPS5 (ath)  SUMM2 (ath)  AT1G12290 (ath)  AT1G15890 (ath)  AT1G51480 (ath)  AT1G52660 (ath)  AT1G61180 (ath)  AT1G61190 (ath)  AT1G61300 (ath)  AT1G61310 (ath)  AT1G62630 (ath)  AT1G63350 (ath)  AT1G63360 (ath)  LOC4325415 (osa)  LOC4325862 (osa)  LOC4336120 (osa)  LOC4346585 (osa)  LOC4346689 (osa)  LOC7461677 (ppo)  LOC7481694 (ppo)  LOC9272234 (osa)  LOC11421862 (mtr)  LOC11424413 (mtr)  LOC25482383 (mtr)  LOC25497292 (mtr)  LOC100241155 (vvi)  LOC100241167 (vvi)  LOC100241170 (vvi)  LOC100241235 (vvi)  LOC100242696 (vvi)  LOC100242909 (vvi)  LOC100246150 (vvi)  LOC100246240 (vvi)  LOC100246379 (vvi)  LOC100247196 (vvi)  LOC100248105 (vvi)  LOC100249639 (vvi)  LOC100249841 (vvi)  LOC100251408 (vvi)  LOC100251433 (vvi)  LOC100254298 (vvi)  LOC100254678 (vvi)  LOC100254876 (vvi)  LOC100254908 (vvi)  LOC100254970 (vvi)  LOC100257093 (vvi)  LOC100258255 (vvi)  LOC100258314 (vvi)  LOC100259933 (vvi)  LOC100260007 (vvi)  LOC100260098 (vvi)  LOC100261532 (vvi)  LOC100261679 (vvi)  LOC100263309 (vvi)  LOC100263392 (vvi)  LOC100264978 (vvi)  LOC100265187 (vvi)  LOC100265292 (vvi)  LOC100265363 (vvi)  LOC100265494 (vvi)  LOC100267014 (vvi)  LOC100781638 (gma)  LOC100854107 (vvi)  LOC103646229 (zma)  LOC103651126 (zma)  LOC103830034 (bra)  LOC103836180 (bra)  LOC103836336 (bra)  LOC103836666 (bra)  LOC103838035 (bra)  LOC103839728 (bra)  LOC103840547 (bra)  LOC103840924 (bra)  LOC103840985 (bra)  LOC103842806 (bra)  LOC103843137 (bra)  LOC103843140 (bra)  LOC103843141 (bra)  LOC103843147 (bra)  LOC103843924 (bra)  LOC103862247 (bra)  LOC103863856 (bra)  LOC103867876 (bra)  LOC103871198 (bra)  LOC103871262 (bra)  LOC103871332 (bra)  LOC103871360 (bra)  LOC103871361 (bra)  LOC103872209 (bra)  LOC103872389 (bra)  LOC104877773 (vvi)  LOC104880229 (vvi)  LOC104880238 (vvi)  LOC104880253 (vvi)  LOC104880254 (vvi)  LOC104880301 (vvi)  LOC104880723 (vvi)  LOC107275341 (osa)  LOC107275558 (osa)  LOC107276074 (osa)  LOC107277809 (osa)  LOC107278834 (osa)  LOC109119058 (sly)  LOC109123115 (vvi)  LOC109123129 (vvi)  LOC109123132 (vvi)  LOC109123189 (vvi) 
Subcellular
localization
wolf
nucl 5,  cyto 3,  plas 1,  cyto_pero 1,  cyto_E.R. 1  (predict for XP_010654915.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 6  (predict for XP_010654915.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
vvi04626 Plant-pathogen interaction 5
Genes directly connected with LOC100248038 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail		 Entrez Gene ID*
5.4 LOC100263444 probable disease resistance protein At1g12280 [detail] 100263444
5.0 LOC100251718 TMV resistance protein N [detail] 100251718
4.3 LOC104879118 protein FREE1 [detail] 104879118
4.3 LOC104881227 uncharacterized LOC104881227 [detail] 104881227
3.8 LOC100267106 probable disease resistance protein At1g58390 [detail] 100267106
3.7 LOC100248105 probable disease resistance protein At1g12280 [detail] 100248105
Coexpressed
gene list		 [Coexpressed gene list for LOC100248038]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 100248038      
Refseq ID (protein) XP_010654915.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].