[←][→] vvi   VIT_00017232001 Gene
functional annotation
Function   probable disease resistance protein At5g63020  
GO BP
GO CC
GO MF
KEGG vvi04626 [list] [network] Plant-pathogen interaction (242 genes)
Protein XP_010654733.1  XP_010654735.1  XP_019077961.1  XP_019077962.1 
BLAST XP_010654733.1  XP_010654735.1  XP_019077961.1  XP_019077962.1 
Orthologous [Ortholog page] AT3G15700 (ath)  AT4G10780 (ath)  RPS2 (ath)  AT5G05400 (ath)  AT5G43730 (ath)  AT5G43740 (ath)  AT5G47250 (ath)  AT5G47260 (ath)  AT5G63020 (ath)  RFL1 (ath)  RPS5 (ath)  SUMM2 (ath)  AT1G12290 (ath)  AT1G15890 (ath)  AT1G51480 (ath)  AT1G52660 (ath)  AT1G61180 (ath)  AT1G61190 (ath)  AT1G61300 (ath)  AT1G61310 (ath)  AT1G62630 (ath)  AT1G63350 (ath)  AT1G63360 (ath)  LOC4325415 (osa)  LOC4325862 (osa)  LOC4336120 (osa)  LOC4346585 (osa)  LOC4346689 (osa)  LOC7461677 (ppo)  LOC7481694 (ppo)  LOC9272234 (osa)  LOC11421862 (mtr)  LOC11424413 (mtr)  LOC25482383 (mtr)  LOC25497292 (mtr)  LOC100241155 (vvi)  LOC100241167 (vvi)  LOC100241170 (vvi)  LOC100241235 (vvi)  LOC100242696 (vvi)  LOC100242909 (vvi)  LOC100246150 (vvi)  LOC100246240 (vvi)  LOC100246379 (vvi)  LOC100247196 (vvi)  LOC100248038 (vvi)  LOC100248105 (vvi)  LOC100249639 (vvi)  LOC100249841 (vvi)  LOC100251408 (vvi)  LOC100251433 (vvi)  LOC100254298 (vvi)  LOC100254678 (vvi)  LOC100254876 (vvi)  LOC100254908 (vvi)  LOC100254970 (vvi)  LOC100257093 (vvi)  LOC100258255 (vvi)  LOC100258314 (vvi)  LOC100259933 (vvi)  LOC100260007 (vvi)  LOC100260098 (vvi)  LOC100261532 (vvi)  LOC100261679 (vvi)  LOC100263309 (vvi)  LOC100263392 (vvi)  LOC100264978 (vvi)  LOC100265187 (vvi)  LOC100265292 (vvi)  LOC100265363 (vvi)  LOC100265494 (vvi)  LOC100267014 (vvi)  LOC100781638 (gma)  LOC100854107 (vvi)  LOC103646229 (zma)  LOC103651126 (zma)  LOC103830034 (bra)  LOC103836180 (bra)  LOC103836336 (bra)  LOC103836666 (bra)  LOC103838035 (bra)  LOC103839728 (bra)  LOC103840547 (bra)  LOC103840924 (bra)  LOC103840985 (bra)  LOC103842806 (bra)  LOC103843137 (bra)  LOC103843140 (bra)  LOC103843141 (bra)  LOC103843147 (bra)  LOC103843924 (bra)  LOC103862247 (bra)  LOC103863856 (bra)  LOC103867876 (bra)  LOC103871198 (bra)  LOC103871262 (bra)  LOC103871332 (bra)  LOC103871360 (bra)  LOC103871361 (bra)  LOC103872209 (bra)  LOC103872389 (bra)  LOC104877773 (vvi)  LOC104880229 (vvi)  LOC104880238 (vvi)  LOC104880253 (vvi)  LOC104880301 (vvi)  LOC104880723 (vvi)  LOC107275341 (osa)  LOC107275558 (osa)  LOC107276074 (osa)  LOC107277809 (osa)  LOC107278834 (osa)  LOC109119058 (sly)  LOC109123115 (vvi)  LOC109123129 (vvi)  LOC109123132 (vvi)  LOC109123189 (vvi) 
Subcellular
localization
wolf
nucl 5,  cyto 2,  chlo 1,  plas 1  (predict for XP_010654733.1)
nucl 5,  cyto 2,  chlo 1,  plas 1  (predict for XP_010654735.1)
nucl 5,  cyto 2,  chlo 1,  plas 1  (predict for XP_019077961.1)
nucl 5,  cyto 2,  chlo 1,  plas 1  (predict for XP_019077962.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 4,  scret 3  (predict for XP_010654733.1)
other 4,  scret 3  (predict for XP_010654735.1)
other 4,  scret 3  (predict for XP_019077961.1)
other 4,  scret 3  (predict for XP_019077962.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with LOC104880254 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail		 Entrez Gene ID*
5.9 LOC100242627 pentatricopeptide repeat-containing protein At5g65560 [detail] 100242627
5.2 LOC100244169 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g63330 [detail] 100244169
4.7 LOC100259083 putative pentatricopeptide repeat-containing protein At1g19290 [detail] 100259083
Coexpressed
gene list		 [Coexpressed gene list for LOC104880254]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 104880254      
Refseq ID (protein) XP_010654733.1 
XP_010654735.1 
XP_019077961.1 
XP_019077962.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].