[][] ath   At1g26420 Gene
functional annotation
Function   FAD-binding Berberine family protein
GO BP
GO:0042435 [list] [network] indole-containing compound biosynthetic process  (62 genes)  IEA  
GO:0009404 [list] [network] toxin metabolic process  (116 genes)  IEA  
GO:0009627 [list] [network] systemic acquired resistance  (117 genes)  IEA  
GO:0002237 [list] [network] response to molecule of bacterial origin  (118 genes)  IEA  
GO:0001666 [list] [network] response to hypoxia  (325 genes)  IEA  
GO:0009751 [list] [network] response to salicylic acid  (438 genes)  IEA  
GO:0002376 [list] [network] immune system process  (453 genes)  IEA  
GO:0046394 [list] [network] carboxylic acid biosynthetic process  (517 genes)  IEA  
GO:0010243 [list] [network] response to organonitrogen compound  (591 genes)  IEA  
GO:0050832 [list] [network] defense response to fungus  (705 genes)  IEA  
GO:0031347 [list] [network] regulation of defense response  (749 genes)  IEA  
GO:0042742 [list] [network] defense response to bacterium  (980 genes)  IEA  
GO:0009415 [list] [network] response to water  (1079 genes)  IEA  
GO:0044248 [list] [network] cellular catabolic process  (1086 genes)  IEA  
GO:0097305 [list] [network] response to alcohol  (1209 genes)  IEA  
GO:0048367 [list] [network] shoot system development  (1318 genes)  IEA  
GO:0007165 [list] [network] signal transduction  (2054 genes)  IEA  
GO CC
GO:0009505 [list] [network] plant-type cell wall  (498 genes)  ISS  
GO:0005737 [list] [network] cytoplasm  (13880 genes)  ISM  
GO MF
GO:0071949 [list] [network] FAD binding  (43 genes)  IEA  
KEGG
Protein NP_173966.1 
BLAST NP_173966.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC732592 (gma)LOC732593 (gma)MEE23 (ath)AT4G20800 (ath)AT4G20820 (ath)AT4G20830 (ath)AT4G20840 (ath)AT4G20860 (ath)AT5G44360 (ath)AT5G44380 (ath)AT5G44390 (ath)AT5G44400 (ath)AT5G44410 (ath)AT5G44440 (ath)AT1G11770 (ath)AT1G26380 (ath)AT1G26390 (ath)AT1G26400 (ath)AT1G26410 (ath)AT1G01980 (ath)AT1G30700 (ath)AT1G30710 (ath)AT1G30760 (ath)AT1G34575 (ath)LOC4341253 (osa)LOC4341254 (osa)LOC4341257 (osa)LOC4341259 (osa)LOC4341261 (osa)LOC7457662 (ppo)LOC7471680 (ppo)LOC7471681 (ppo)LOC7480379 (ppo)LOC7480381 (ppo)LOC7480383 (ppo)LOC7480394 (ppo)LOC7480395 (ppo)LOC7480398 (ppo)LOC7480399 (ppo)LOC7480401 (ppo)LOC7480403 (ppo)LOC7480406 (ppo)LOC7480408 (ppo)LOC7480409 (ppo)LOC7480417 (ppo)LOC7480418 (ppo)LOC7484482 (ppo)LOC7485160 (ppo)LOC7485161 (ppo)LOC7485205 (ppo)LOC7489102 (ppo)LOC7489103 (ppo)LOC7489112 (ppo)LOC7489114 (ppo)LOC7489115 (ppo)LOC7489116 (ppo)LOC7489117 (ppo)LOC11406991 (mtr)LOC11407647 (mtr)LOC11415235 (mtr)LOC11415951 (mtr)LOC11416804 (mtr)LOC11418784 (mtr)LOC11420001 (mtr)LOC11422032 (mtr)LOC11422989 (mtr)LOC11424412 (mtr)LOC11429520 (mtr)LOC18095776 (ppo)LOC18096028 (ppo)LOC18103477 (ppo)LOC18103479 (ppo)LOC18103480 (ppo)LOC18103481 (ppo)LOC18103482 (ppo)LOC18103487 (ppo)LOC18103492 (ppo)LOC18103495 (ppo)LOC18103496 (ppo)LOC18103497 (ppo)LOC18103499 (ppo)LOC18103509 (ppo)LOC18103510 (ppo)LOC18103511 (ppo)LOC18103513 (ppo)LOC18105648 (ppo)LOC18109453 (ppo)LOC25486180 (mtr)LOC25486316 (mtr)LOC25486318 (mtr)LOC25486319 (mtr)LOC25492422 (mtr)LOC25493091 (mtr)LOC25493334 (mtr)LOC25493352 (mtr)LOC25493353 (mtr)LOC25493354 (mtr)LOC25493355 (mtr)LOC25493356 (mtr)LOC25493357 (mtr)LOC25493364 (mtr)LOC25493365 (mtr)LOC25493366 (mtr)LOC25495604 (mtr)LOC100775353 (gma)LOC100775893 (gma)LOC100776438 (gma)LOC100777594 (gma)LOC100778568 (gma)LOC100779395 (gma)LOC100780114 (gma)LOC100780461 (gma)LOC100781004 (gma)LOC100781731 (gma)LOC100782093 (gma)LOC100782292 (gma)LOC100782631 (gma)LOC100786800 (gma)LOC100788228 (gma)LOC100788233 (gma)LOC100794074 (gma)LOC100796276 (gma)LOC100796809 (gma)LOC100797188 (gma)LOC100797739 (gma)LOC100799990 (gma)LOC100800519 (gma)LOC100801058 (gma)LOC100802131 (gma)LOC100803041 (gma)LOC100807459 (gma)LOC100807998 (gma)LOC100810481 (gma)LOC100811019 (gma)LOC100811558 (gma)LOC100812087 (gma)LOC100813175 (gma)LOC100813706 (gma)LOC101246398 (sly)LOC101246685 (sly)LOC101249413 (sly)LOC101249763 (sly)LOC101254601 (sly)LOC101254908 (sly)LOC101254965 (sly)LOC101255262 (sly)LOC101255854 (sly)LOC101256448 (sly)LOC101263376 (sly)LOC101263972 (sly)LOC101264289 (sly)LOC101264571 (sly)LOC101264701 (sly)LOC101265002 (sly)LOC101265308 (sly)LOC101265606 (sly)LOC102662170 (gma)LOC103827902 (bra)LOC103827906 (bra)LOC103828799 (bra)LOC103828803 (bra)LOC103834173 (bra)LOC103839175 (bra)LOC103839178 (bra)LOC103839179 (bra)LOC103839182 (bra)LOC103839321 (bra)LOC103839322 (bra)LOC103840305 (bra)LOC103840312 (bra)LOC103840313 (bra)LOC103840613 (bra)LOC103840614 (bra)LOC103841228 (bra)LOC103843225 (bra)LOC103850258 (bra)LOC103857550 (bra)LOC103858368 (bra)LOC103858377 (bra)LOC103858400 (bra)LOC103858408 (bra)LOC103858430 (bra)LOC103858724 (bra)LOC103861201 (bra)LOC103861202 (bra)LOC103865354 (bra)LOC103867418 (bra)LOC103871928 (bra)LOC104645788 (sly)LOC104646055 (sly)LOC107275394 (osa)LOC108869423 (bra)LOC112323320 (ppo)LOC112323321 (ppo)LOC112323322 (ppo)LOC112323328 (ppo)LOC112323330 (ppo)LOC112324786 (ppo)LOC112324789 (ppo)LOC112325984 (ppo)LOC112329148 (ppo)LOC112421407 (mtr)LOC117125831 (bra)LOC120580904 (mtr)LOC123039084 (tae)LOC123043821 (tae)LOC123044031 (tae)LOC123048809 (tae)LOC123051687 (tae)LOC123051908 (tae)LOC123056682 (tae)LOC123069860 (tae)LOC123101225 (tae)LOC123104138 (tae)LOC123121890 (tae)LOC123151640 (tae)LOC123151641 (tae)LOC123151651 (tae)LOC123154502 (tae)LOC123154697 (tae)LOC123159831 (tae)LOC123160014 (tae)LOC123160305 (tae)LOC123160322 (tae)LOC123160325 (tae)LOC123160531 (tae)LOC123166878 (tae)LOC123166970 (tae)LOC123167086 (tae)LOC123167432 (tae)LOC123168236 (tae)LOC123169320 (tae)LOC123171182 (tae)LOC123172934 (tae)LOC123178742 (tae)LOC123182957 (tae)LOC123183295 (tae)LOC123184816 (tae)LOC123184818 (tae)LOC123396132 (hvu)LOC123407824 (hvu)LOC123409363 (hvu)LOC123411150 (hvu)LOC123411227 (hvu)LOC123411684 (hvu)LOC123413019 (hvu)LOC123421037 (hvu)LOC123425140 (hvu)LOC123425397 (hvu)LOC123429002 (hvu)LOC123429003 (hvu)LOC123429523 (hvu)
Subcellular
localization
wolf
extr 4,  E.R. 3,  chlo 1,  nucl 1,  cyto 1,  mito 1,  vacu 1,  cyto_nucl 1,  chlo_mito 1  (predict for NP_173966.1)
Subcellular
localization
TargetP
scret 6  (predict for NP_173966.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
ath00480 Glutathione metabolism 2
Genes directly connected with AT1G26420 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
18.2 AT1G26380 FAD-binding Berberine family protein [detail] 839180
15.4 AT1G26410 FAD-binding Berberine family protein [detail] 839183
11.8 GSTF7 glutathione S-transferase 7 [detail] 839295
10.3 AT1G51890 Leucine-rich repeat protein kinase family protein [detail] 841616
9.1 WAKL10 WALL ASSOCIATED KINASE (WAK)-LIKE 10 [detail] 844307
8.6 GSTF6 glutathione S-transferase 6 [detail] 839515
8.2 FRK1 FLG22-induced receptor-like kinase 1 [detail] 816436
8.0 CRK20 cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 20 [detail] 828427
7.5 AT4G20000 VQ motif-containing protein [detail] 827745
7.1 CYP71B23 cytochrome P450, family 71, subfamily B, polypeptide 23 [detail] 822222
6.4 AT5G42830 HXXXD-type acyl-transferase family protein [detail] 834294
6.3 AT1G36622 uncharacterized protein [detail] 5007772
6.0 AT1G49000 uncharacterized protein [detail] 841322
4.7 CRK31 cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 31 [detail] 826752
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for AT1G26420]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
261005_at
261005_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
261005_at
261005_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
261005_at
261005_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 839184    
Refseq ID (protein) NP_173966.1 


The preparation time of this page was 0.2 [sec].