[][] ath   AT5G44380 Gene
functional annotation
Function   FAD-binding Berberine family protein
GO BP
GO:0006979 [list] [network] response to oxidative stress  (442 genes)  IEP  
GO:0055114 [list] [network] oxidation-reduction process  (1468 genes)  IEA  
GO CC
GO:0005618 [list] [network] cell wall  (685 genes)  IDA  
GO:0009506 [list] [network] plasmodesma  (962 genes)  IDA  
GO:0005576 [list] [network] extracellular region  (3363 genes)  IEA  
GO:0009507 [list] [network] chloroplast  (5095 genes)  ISM  
GO:0005737 [list] [network] cytoplasm  (14855 genes)  ISM  
GO MF
GO:0071949 [list] [network] FAD binding  (68 genes)  IEA  
GO:0016491 [list] [network] oxidoreductase activity  (1435 genes)  IEA  
KEGG
Protein NP_001330998.1  NP_199251.1 
BLAST NP_001330998.1  NP_199251.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC732592 (gma)LOC732593 (gma)MEE23 (ath)AT4G20820 (ath)AT4G20860 (ath)AT5G44360 (ath)AT5G44390 (ath)AT5G44400 (ath)AT5G44410 (ath)AT5G44440 (ath)AT1G30700 (ath)AT1G30760 (ath)LOC4341253 (osa)LOC4341257 (osa)LOC4341258 (osa)LOC4341259 (osa)LOC4341261 (osa)LOC7457662 (ppo)LOC7471681 (ppo)LOC7480403 (ppo)LOC7480408 (ppo)LOC7480409 (ppo)LOC7480410 (ppo)LOC7485160 (ppo)LOC7485161 (ppo)LOC7489112 (ppo)LOC7489114 (ppo)LOC7489116 (ppo)LOC7489117 (ppo)LOC11406991 (mtr)LOC11415235 (mtr)LOC11415951 (mtr)LOC11416804 (mtr)LOC11422032 (mtr)LOC11422989 (mtr)LOC25486316 (mtr)LOC25486318 (mtr)LOC25486319 (mtr)LOC25493334 (mtr)LOC25493352 (mtr)LOC25493353 (mtr)LOC25493354 (mtr)LOC25493355 (mtr)LOC25493356 (mtr)LOC25493357 (mtr)LOC25493365 (mtr)LOC25493366 (mtr)LOC100242277 (vvi)LOC100243731 (vvi)LOC100245584 (vvi)LOC100247412 (vvi)LOC100248870 (vvi)LOC100250740 (vvi)LOC100252519 (vvi)LOC100253961 (vvi)LOC100255905 (vvi)LOC100266314 (vvi)LOC100267923 (vvi)LOC100276794 (zma)LOC100282250 (zma)LOC100775353 (gma)LOC100777594 (gma)LOC100778568 (gma)LOC100779395 (gma)LOC100780114 (gma)LOC100780461 (gma)LOC100781004 (gma)LOC100782093 (gma)LOC100782292 (gma)LOC100782631 (gma)LOC100786800 (gma)LOC100794074 (gma)LOC100796276 (gma)LOC100799990 (gma)LOC100800519 (gma)LOC100801058 (gma)LOC100802131 (gma)LOC100803041 (gma)LOC100810481 (gma)LOC100811019 (gma)LOC100811558 (gma)LOC100812087 (gma)LOC100813706 (gma)LOC101249413 (sly)LOC101249763 (sly)LOC101254601 (sly)LOC101254908 (sly)LOC101254965 (sly)LOC101255262 (sly)LOC101255854 (sly)LOC101256448 (sly)LOC101263376 (sly)LOC101263972 (sly)LOC101264289 (sly)LOC101265606 (sly)LOC102662170 (gma)LOC103629835 (zma)LOC103629842 (zma)LOC103638604 (zma)LOC103827902 (bra)LOC103827906 (bra)LOC103828799 (bra)LOC103839175 (bra)LOC103839178 (bra)LOC103839179 (bra)LOC103839182 (bra)LOC103839322 (bra)LOC103840305 (bra)LOC103840313 (bra)LOC103841228 (bra)LOC103858400 (bra)LOC103858430 (bra)LOC103858724 (bra)LOC103867418 (bra)LOC104645788 (sly)LOC104646055 (sly)LOC107275394 (osa)
Subcellular
localization
wolf
chlo 6,  nucl 1,  mito 1,  extr 1,  vacu 1,  golg 1,  cyto_nucl 1,  cysk_nucl 1,  nucl_plas 1  (predict for NP_001330998.1)
chlo 2,  vacu 2,  nucl 1,  extr 1,  golg 1,  chlo_mito 1,  E.R._vacu 1  (predict for NP_199251.1)
Subcellular
localization
TargetP
mito 1  (predict for NP_001330998.1)
scret 4  (predict for NP_199251.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
ath00940 Phenylpropanoid biosynthesis 3
Genes directly connected with AT5G44380 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail
Entrez Gene ID*
7.0 AT5G64100 Peroxidase superfamily protein [detail] 836531
6.5 KAT3 potassium channel protein [detail] 829400
6.5 FLS5 flavonol synthase 5 [detail] 836480
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for AT5G44380]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
249045_at
249045_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
249045_at
249045_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
249045_at
249045_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 834464    
Refseq ID (protein) NP_001330998.1 
NP_199251.1 


The preparation time of this page was 0.2 [sec].