[][] ath   AT5G44440 Gene
functional annotation
Function   FAD-binding Berberine family protein
GO BP
GO:0009651 [list] [network] response to salt stress  (485 genes)  IMP  
GO:0055114 [list] [network] oxidation-reduction process  (1468 genes)  IEA  
GO CC
GO:0005576 [list] [network] extracellular region  (3363 genes)  IEA  
GO:0009507 [list] [network] chloroplast  (5095 genes)  ISM  
GO:0005737 [list] [network] cytoplasm  (14855 genes)  ISM  
GO MF
GO:0071949 [list] [network] FAD binding  (68 genes)  IEA  
GO:0016491 [list] [network] oxidoreductase activity  (1435 genes)  IEA  
KEGG
Protein NP_001331909.1  NP_199257.1 
BLAST NP_001331909.1  NP_199257.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC732592 (gma)LOC732593 (gma)MEE23 (ath)AT4G20820 (ath)AT4G20860 (ath)AT5G44360 (ath)AT5G44380 (ath)AT5G44390 (ath)AT5G44400 (ath)AT5G44410 (ath)AT1G30700 (ath)AT1G30760 (ath)LOC4341253 (osa)LOC4341257 (osa)LOC4341258 (osa)LOC4341259 (osa)LOC4341261 (osa)LOC7457662 (ppo)LOC7471681 (ppo)LOC7480403 (ppo)LOC7480408 (ppo)LOC7480409 (ppo)LOC7480410 (ppo)LOC7485160 (ppo)LOC7485161 (ppo)LOC7489112 (ppo)LOC7489114 (ppo)LOC7489116 (ppo)LOC7489117 (ppo)LOC11406991 (mtr)LOC11415235 (mtr)LOC11415951 (mtr)LOC11416804 (mtr)LOC11422032 (mtr)LOC11422989 (mtr)LOC25486316 (mtr)LOC25486318 (mtr)LOC25486319 (mtr)LOC25493334 (mtr)LOC25493352 (mtr)LOC25493353 (mtr)LOC25493354 (mtr)LOC25493355 (mtr)LOC25493356 (mtr)LOC25493357 (mtr)LOC25493365 (mtr)LOC25493366 (mtr)LOC100242277 (vvi)LOC100243731 (vvi)LOC100245584 (vvi)LOC100247412 (vvi)LOC100248870 (vvi)LOC100250740 (vvi)LOC100252519 (vvi)LOC100253961 (vvi)LOC100255905 (vvi)LOC100266314 (vvi)LOC100267923 (vvi)LOC100276794 (zma)LOC100282250 (zma)LOC100775353 (gma)LOC100777594 (gma)LOC100778568 (gma)LOC100779395 (gma)LOC100780114 (gma)LOC100780461 (gma)LOC100781004 (gma)LOC100782093 (gma)LOC100782292 (gma)LOC100782631 (gma)LOC100786800 (gma)LOC100794074 (gma)LOC100796276 (gma)LOC100799990 (gma)LOC100800519 (gma)LOC100801058 (gma)LOC100802131 (gma)LOC100803041 (gma)LOC100810481 (gma)LOC100811019 (gma)LOC100811558 (gma)LOC100812087 (gma)LOC100813706 (gma)LOC101249413 (sly)LOC101249763 (sly)LOC101254601 (sly)LOC101254908 (sly)LOC101254965 (sly)LOC101255262 (sly)LOC101255854 (sly)LOC101256448 (sly)LOC101263376 (sly)LOC101263972 (sly)LOC101264289 (sly)LOC101265606 (sly)LOC102662170 (gma)LOC103629835 (zma)LOC103629842 (zma)LOC103638604 (zma)LOC103827902 (bra)LOC103827906 (bra)LOC103828799 (bra)LOC103839175 (bra)LOC103839178 (bra)LOC103839179 (bra)LOC103839182 (bra)LOC103839322 (bra)LOC103840305 (bra)LOC103840313 (bra)LOC103841228 (bra)LOC103858400 (bra)LOC103858430 (bra)LOC103858724 (bra)LOC103867418 (bra)LOC104645788 (sly)LOC104646055 (sly)LOC107275394 (osa)
Subcellular
localization
wolf
chlo 4,  mito 2,  E.R. 2,  cyto 1,  E.R._plas 1,  mito_plas 1  (predict for NP_001331909.1)
chlo 3,  extr 2,  nucl 1,  plas 1,  nucl_plas 1  (predict for NP_199257.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 8,  mito 4  (predict for NP_001331909.1)
scret 9  (predict for NP_199257.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with AT5G44440 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail
Entrez Gene ID*
4.4 HEC1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [detail] 836841
4.4 ORP4C OSBP(oxysterol binding protein)-related protein 4C [detail] 835830
4.0 AT1G72290 Kunitz family trypsin and protease inhibitor protein [detail] 843561
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for AT5G44440]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
249053_at
249053_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
249053_at
249053_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
249053_at
249053_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 834471    
Refseq ID (protein) NP_001331909.1 
NP_199257.1 


The preparation time of this page was 0.2 [sec].