Select Species**


OK


Orthologous genes in OrthoFinder**

Species Gene Description
 ghi-r.1  107892222  uncharacterized LOC107892222 
 ghi-r.1  107915142  60S ribosomal protein L8-1 
 ghi-r.1  107920472  uncharacterized LOC107920472 
 ghi-r.1  107946461  protein PSK SIMULATOR 1 

close


Top 50 coexpressed genes to 107892222 (ghi-r.1 coexpression data)

 KEGG ID   Pathway name   #genes in coex list   #genes in genome   -log10(p)   Link to the KEGG* map 
(Multiple genes)

close

close

Top 50 enrichment test to 107892222 (ghi-r.1 coexpression data)

CoexMap"107892222"


ghiLOC107892222 | Entrez gene ID : 107892222
Species ghi gma zma sbi sly cit ath nta tae mtr osa hvu bna bdi vvi bra sot cre ppo
Paralog 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Show/Hide Columns:        



CoexMap
Chloroplast
Nucleus

functional annotation
KEGG ghi04120 [list] [network] Ubiquitin mediated proteolysis (368 genes)
GO BP
GO CC
GO MF
Protein XP_040957709.1 [sequence] [blastp]
XP_040957710.1 [sequence] [blastp]
XP_040957711.1 [sequence] [blastp]
XP_040957712.1 [sequence] [blastp]
XP_040957713.1 [sequence] [blastp]
XP_040957714.1 [sequence] [blastp]
XP_040957715.1 [sequence] [blastp]
XP_040957716.1 [sequence] [blastp]
XP_040957717.1 [sequence] [blastp]
XP_040957718.1 [sequence] [blastp]
Subcellular
localization
wolf
chlo 3,  nucl 1,  cyto 1,  extr 1,  cyto_nucl 1,  mito 1,  plas 1,  vacu 1,  E.R. 1,  cysk_nucl 1,  E.R._vacu 1,  cyto_pero 1,  E.R._plas 1,  mito_plas 1  (predict for XP_040957709.1)
chlo 3,  nucl 1,  cyto 1,  extr 1,  cyto_nucl 1,  mito 1,  plas 1,  vacu 1,  E.R. 1,  cysk_nucl 1,  E.R._vacu 1,  cyto_pero 1,  E.R._plas 1,  mito_plas 1  (predict for XP_040957710.1)
chlo 3,  nucl 1,  cyto 1,  extr 1,  cyto_nucl 1,  mito 1,  plas 1,  vacu 1,  E.R. 1,  cysk_nucl 1,  E.R._vacu 1,  cyto_pero 1,  E.R._plas 1,  mito_plas 1  (predict for XP_040957711.1)
chlo 3,  nucl 1,  cyto 1,  extr 1,  cyto_nucl 1,  mito 1,  plas 1,  vacu 1,  E.R. 1,  cysk_nucl 1,  E.R._vacu 1,  cyto_pero 1,  E.R._plas 1,  mito_plas 1  (predict for XP_040957712.1)
chlo 3,  nucl 1,  cyto 1,  extr 1,  cyto_nucl 1,  mito 1,  plas 1,  vacu 1,  E.R. 1,  cysk_nucl 1,  E.R._vacu 1,  cyto_pero 1,  E.R._plas 1,  mito_plas 1  (predict for XP_040957713.1)
chlo 4,  extr 2,  cyto 1,  nucl 1,  mito 1,  vacu 1,  cyto_pero 1,  cyto_E.R. 1,  cyto_plas 1  (predict for XP_040957714.1)
chlo 4,  extr 2,  cyto 1,  nucl 1,  mito 1,  vacu 1,  cyto_pero 1,  cyto_E.R. 1,  cyto_plas 1  (predict for XP_040957715.1)
chlo 2,  extr 2,  nucl 1,  vacu 1,  chlo_mito 1,  cysk_nucl 1  (predict for XP_040957716.1)
chlo 2,  extr 2,  nucl 1,  vacu 1,  chlo_mito 1,  cysk_nucl 1  (predict for XP_040957717.1)
chlo 5,  cyto 1,  extr 1,  plas 1,  vacu 1,  E.R. 1,  cyto_nucl 1,  E.R._vacu 1,  cyto_pero 1,  E.R._plas 1  (predict for XP_040957718.1)
Subcellular
localization
TargetP
scret 9,  other 3  (predict for XP_040957709.1)
scret 9,  other 3  (predict for XP_040957710.1)
scret 9,  other 3  (predict for XP_040957711.1)
scret 9,  other 3  (predict for XP_040957712.1)
scret 9,  other 3  (predict for XP_040957713.1)
scret 9,  other 5  (predict for XP_040957714.1)
scret 9,  other 5  (predict for XP_040957715.1)
scret 8,  other 8  (predict for XP_040957716.1)
scret 8,  other 8  (predict for XP_040957717.1)
scret 9,  other 3  (predict for XP_040957718.1)
Gene expression
All samples [Expression pattern]
Tissue specificity*
Show Coexpressed Genes
Gene Function KEGG Entrez
Gene
ID
Other ID Link Target Reference

ghi-r.1
for
107892222


ghi-r.1
for
107915142


ghi-r.1
for
107920472


ghi-r.1
for
107946461



Ortholog ID: 21509
Species ghi ghi ghi
Symbol LOC107915142 LOC107920472 LOC107954556
Function* 60S ribosomal protein L8-1 uncharacterized LOC107920472 uncharacterized LOC107954556
Coexmap

Please wait a moment.

Please wait a moment.

Please wait a moment.

Coexpression

Please wait a moment.

Please wait a moment.

Please wait a moment.

KEGG Info
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
ghi03010 Ribosome 9
Expression Expression pattern Expression pattern Expression pattern
Entrez Gene ID* 107915142 107920472 107954556
The preparation time of this page was 0.1 [sec].