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Orthologous genes in OrthoFinder**

Species Gene Description
 ghi-r.1   107948266   DNA ligase 1 

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Top 50 coexpressed genes to 107948266 (ghi-r.1 coexpression data)

 KEGG ID   Pathway name   #genes in coex list   #genes in genome   -log10(p)   Link to the KEGG* map 
(Multiple genes)

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Top 50 enrichment test to 107948266 (ghi-r.1 coexpression data)

CoexMap"107948266"


ghiLOC107948266 | Entrez gene ID : 107948266    
Species ghi ppo cit hvu bdi sot sbi ath gma bna osa cre mtr vvi sly bra tae nta zma
Paralog 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
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CoexMap
Chloroplast
Nucleus

functional annotation
KEGG
GO BP
GO:0006273 [list] [network] lagging strand elongation  (13 genes)  IEA  
GO:0006310 [list] [network] DNA recombination  (262 genes)  IEA  
GO:0006281 [list] [network] DNA repair  (557 genes)  IEA  
GO CC
GO:0005739 [list] [network] mitochondrion  (1525 genes)  IEA  
GO:0005634 [list] [network] nucleus  (7681 genes)  IEA  
GO MF
GO:0003910 [list] [network] DNA ligase (ATP) activity  (15 genes)  IEA  
GO:0005524 [list] [network] ATP binding  (5155 genes)  IEA  
Protein XP_016738249.1 [sequence] [blastp]
XP_016738251.1 [sequence] [blastp]
XP_040954734.1 [sequence] [blastp]
XP_040954735.1 [sequence] [blastp]
XP_040954736.1 [sequence] [blastp]
XP_040954737.1 [sequence] [blastp]
XP_040954738.1 [sequence] [blastp]
XP_040954739.1 [sequence] [blastp]
XP_040954740.1 [sequence] [blastp]
XP_040954741.1 [sequence] [blastp]
XP_040954742.1 [sequence] [blastp]
Subcellular
localization
wolf
mito 4,  chlo_mito 3,  nucl 2,  cyto 1,  chlo 1,  cysk_nucl 1,  nucl_plas 1  (predict for XP_016738249.1)
cyto_nucl 4,  mito 3,  chlo_mito 3,  nucl 3,  chlo 2  (predict for XP_016738251.1)
mito 4,  cyto_mito 3,  chlo 1,  nucl 1,  plas 1,  nucl_plas 1  (predict for XP_040954734.1)
mito 6,  chlo_mito 4,  cyto_mito 3,  chlo 1,  nucl 1,  cyto 1,  plas 1,  golg 1,  cyto_nucl 1,  nucl_plas 1,  golg_plas 1,  cyto_plas 1  (predict for XP_040954735.1)
mito 4,  cyto_mito 3,  chlo 1,  nucl 1,  plas 1,  nucl_plas 1  (predict for XP_040954736.1)
mito 5,  cyto_mito 3,  nucl 2,  chlo 1,  plas 1,  golg 1,  golg_plas 1  (predict for XP_040954737.1)
mito 3,  nucl 2,  cyto 2,  cyto_nucl 2,  chlo_mito 2  (predict for XP_040954738.1)
mito 5,  cyto_mito 3,  nucl 2,  chlo 1,  plas 1,  golg 1,  golg_plas 1  (predict for XP_040954739.1)
chlo 4,  chlo_mito 4,  mito 1,  nucl 1,  cyto 1,  cyto_nucl 1  (predict for XP_040954740.1)
chlo 4,  chlo_mito 4,  mito 1,  nucl 1,  cyto 1,  cyto_nucl 1  (predict for XP_040954741.1)
cyto_nucl 4,  mito 3,  chlo_mito 3,  nucl 3,  chlo 2  (predict for XP_040954742.1)
Subcellular
localization
TargetP
scret 8  (predict for XP_016738249.1)
scret 8  (predict for XP_016738251.1)
scret 8  (predict for XP_040954734.1)
scret 8  (predict for XP_040954735.1)
scret 8  (predict for XP_040954736.1)
scret 8  (predict for XP_040954737.1)
scret 8  (predict for XP_040954738.1)
scret 8  (predict for XP_040954739.1)
scret 8  (predict for XP_040954740.1)
scret 8  (predict for XP_040954741.1)
scret 8  (predict for XP_040954742.1)
Gene expression
All samples [Expression pattern]
Tissue specificity*
Show Coexpressed Genes
Gene Function KEGG Entrez
Gene
ID		 Other ID Link Target

ghi-r.1
for
107948266

.


Ortholog ID: None
Species
Symbol
Function*
Coexmap
Coexpression
KEGG Info
Expression
Entrez Gene ID*
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