[][] vvi   VIT_00019774001 Gene
functional annotation
Function   tubulin beta-2 chain
GO BP
GO CC
GO MF
KEGG vvi04145 [list] [network] Phagosome (93 genes)
Protein XP_002271992.1 
BLAST XP_002271992.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC542239 (zma)LOC542380 (zma)LOC542416 (zma)LOC542417 (zma)LOC542418 (zma)LOC542705 (zma)TUBB3 (gma)TUBB (gma)TUB (sly)TUB7 (ath)TUB9 (ath)TUB6 (ath)TUB8 (ath)TUB4 (ath)TUB2 (ath)TUB3 (ath)TUB5 (ath)TUB1 (ath)LOC4326917 (osa)LOC4327550 (osa)LOC4328420 (osa)LOC4331315 (osa)LOC4333632 (osa)LOC4334309 (osa)LOC4338790 (osa)LOC4341810 (osa)LOC7464075 (ppo)LOC7465852 (ppo)LOC7465861 (ppo)LOC7471684 (ppo)LOC7472769 (ppo)LOC7477677 (ppo)LOC7479116 (ppo)LOC7479658 (ppo)LOC7481503 (ppo)LOC7486729 (ppo)LOC11414871 (mtr)LOC11415767 (mtr)LOC11422693 (mtr)LOC11425110 (mtr)LOC11437601 (mtr)LOC11438618 (mtr)LOC11439086 (mtr)LOC11442516 (mtr)LOC25491473 (mtr)LOC25493371 (mtr)LOC100244399 (vvi)LOC100244729 (vvi)LOC100258042 (vvi)LOC100259087 (vvi)LOC100259401 (vvi)LOC100259534 (vvi)LOC100260443 (vvi)LOC100261736 (vvi)LOC100265052 (vvi)LOC100272336 (zma)LOC100273658 (zma)LOC100382290 (zma)LOC100383576 (zma)LOC100502086 (zma)TUBB1 (gma)LOC100781043 (gma)LOC100781525 (gma)LOC100784236 (gma)LOC100788253 (gma)LOC100793406 (gma)LOC100797652 (gma)LOC100797894 (gma)LOC100798849 (gma)LOC100801608 (gma)TUBB2 (gma)LOC100816898 (gma)LOC100818878 (gma)LOC100819408 (gma)LOC100819883 (gma)LOC101246411 (sly)LOC101248630 (sly)LOC101248956 (sly)LOC101251552 (sly)LOC101252240 (sly)LOC101253952 (sly)LOC101262621 (sly)LOC101262728 (sly)LOC101265829 (sly)LOC103625832 (zma)LOC103629648 (zma)LOC103827910 (bra)LOC103832026 (bra)LOC103834176 (bra)LOC103839187 (bra)LOC103846653 (bra)LOC103848440 (bra)LOC103858467 (bra)LOC103861207 (bra)LOC103864974 (bra)LOC103867806 (bra)LOC103868027 (bra)LOC103873285 (bra)LOC103873591 (bra)LOC103873913 (bra)LOC103874246 (bra)LOC103874709 (bra)
Subcellular
localization
wolf
nucl 6,  cyto 3,  nucl_plas 3  (predict for XP_002271992.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 8  (predict for XP_002271992.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
vvi04145 Phagosome 6
vvi01230 Biosynthesis of amino acids 5
vvi01200 Carbon metabolism 4
vvi00270 Cysteine and methionine metabolism 4
vvi00260 Glycine, serine and threonine metabolism 3
Genes directly connected with LOC100247828 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail
Entrez Gene ID*
4.9 LOC100248779 serine hydroxymethyltransferase 4 [detail] 100248779
4.7 METK5 S-adenosylmethionine synthetase 5 [detail] 100243560
4.7 LOC100256600 tubulin alpha chain [detail] 100256600
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for LOC100247828]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 100247828    
Refseq ID (protein) XP_002271992.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].