[][] ppo   POPTR_002G021800v3 Gene
functional annotation
Function   tubulin beta chain
GO BP
GO CC
GO MF
KEGG pop04145 [list] [network] Phagosome (66 genes)
Protein XP_002300703.1 
BLAST XP_002300703.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC542239 (zma)LOC542380 (zma)LOC542416 (zma)LOC542417 (zma)LOC542418 (zma)LOC542705 (zma)TUBB3 (gma)TUBB (gma)TUB (sly)TUB7 (ath)TUB9 (ath)TUB6 (ath)TUB8 (ath)TUB4 (ath)TUB2 (ath)TUB3 (ath)TUB5 (ath)TUB1 (ath)LOC4326917 (osa)LOC4327550 (osa)LOC4328420 (osa)LOC4331315 (osa)LOC4333632 (osa)LOC4334309 (osa)LOC4338790 (osa)LOC4341810 (osa)LOC7464075 (ppo)LOC7465852 (ppo)LOC7465861 (ppo)LOC7471684 (ppo)LOC7472769 (ppo)LOC7477677 (ppo)LOC7479658 (ppo)LOC7481503 (ppo)LOC7486729 (ppo)LOC11414871 (mtr)LOC11415767 (mtr)LOC11422693 (mtr)LOC11425110 (mtr)LOC11437601 (mtr)LOC11438618 (mtr)LOC11439086 (mtr)LOC11442516 (mtr)LOC25491473 (mtr)LOC25493371 (mtr)LOC100244399 (vvi)LOC100244729 (vvi)LOC100247828 (vvi)LOC100258042 (vvi)LOC100259087 (vvi)LOC100259401 (vvi)LOC100259534 (vvi)LOC100260443 (vvi)LOC100261736 (vvi)LOC100265052 (vvi)LOC100272336 (zma)LOC100273658 (zma)LOC100382290 (zma)LOC100383576 (zma)LOC100502086 (zma)TUBB1 (gma)LOC100781043 (gma)LOC100781525 (gma)LOC100784236 (gma)LOC100788253 (gma)LOC100793406 (gma)LOC100797652 (gma)LOC100797894 (gma)LOC100798849 (gma)LOC100801608 (gma)TUBB2 (gma)LOC100816898 (gma)LOC100818878 (gma)LOC100819408 (gma)LOC100819883 (gma)LOC101246411 (sly)LOC101248630 (sly)LOC101248956 (sly)LOC101251552 (sly)LOC101252240 (sly)LOC101253952 (sly)LOC101262621 (sly)LOC101262728 (sly)LOC101265829 (sly)LOC103625832 (zma)LOC103629648 (zma)LOC103827910 (bra)LOC103832026 (bra)LOC103834176 (bra)LOC103839187 (bra)LOC103846653 (bra)LOC103848440 (bra)LOC103858467 (bra)LOC103861207 (bra)LOC103864974 (bra)LOC103867806 (bra)LOC103868027 (bra)LOC103873285 (bra)LOC103873591 (bra)LOC103873913 (bra)LOC103874246 (bra)LOC103874709 (bra)
Subcellular
localization
wolf
nucl 6,  cyto 3,  nucl_plas 3  (predict for XP_002300703.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 8  (predict for XP_002300703.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
ppo04145 Phagosome 5
ppo00564 Glycerophospholipid metabolism 2
ppo00520 Amino sugar and nucleotide sugar metabolism 2
Genes directly connected with LOC7479116 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail
Entrez Gene ID*
6.5 LOC7464075 tubulin beta-5 chain [detail] 7464075
5.8 LOC7465861 tubulin beta chain [detail] 7465861
5.4 LOC7457369 delta(8)-fatty-acid desaturase 2 [detail] 7457369
4.3 LOC7487979 mannose-1-phosphate guanylyltransferase 1 [detail] 7487979
3.5 LOC7480052 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase 3 [detail] 7480052
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for LOC7479116]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 7479116    
Refseq ID (protein) XP_002300703.1 


The preparation time of this page was 0.2 [sec].