[][] ppo   POPTR_006G035400v3 Gene
functional annotation
Function   tubulin beta-5 chain
GO BP
GO CC
GO MF
KEGG pop04145 [list] [network] Phagosome (66 genes)
Protein XP_002307960.1  XP_006380970.1  XP_024459838.1 
BLAST XP_002307960.1  XP_006380970.1  XP_024459838.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC542239 (zma)LOC542380 (zma)LOC542416 (zma)LOC542417 (zma)LOC542418 (zma)LOC542705 (zma)TUBB3 (gma)TUBB (gma)TUB (sly)TUB7 (ath)TUB9 (ath)TUB6 (ath)TUB8 (ath)TUB4 (ath)TUB2 (ath)TUB3 (ath)TUB5 (ath)TUB1 (ath)LOC4326917 (osa)LOC4327550 (osa)LOC4328420 (osa)LOC4331315 (osa)LOC4333632 (osa)LOC4334309 (osa)LOC4338790 (osa)LOC4341810 (osa)LOC7464075 (ppo)LOC7465852 (ppo)LOC7465861 (ppo)LOC7471684 (ppo)LOC7472769 (ppo)LOC7477677 (ppo)LOC7479116 (ppo)LOC7481503 (ppo)LOC7486729 (ppo)LOC11414871 (mtr)LOC11415767 (mtr)LOC11422693 (mtr)LOC11425110 (mtr)LOC11437601 (mtr)LOC11438618 (mtr)LOC11439086 (mtr)LOC11442516 (mtr)LOC25491473 (mtr)LOC25493371 (mtr)LOC100244399 (vvi)LOC100244729 (vvi)LOC100247828 (vvi)LOC100258042 (vvi)LOC100259087 (vvi)LOC100259401 (vvi)LOC100259534 (vvi)LOC100260443 (vvi)LOC100261736 (vvi)LOC100265052 (vvi)LOC100272336 (zma)LOC100273658 (zma)LOC100382290 (zma)LOC100383576 (zma)LOC100502086 (zma)TUBB1 (gma)LOC100781043 (gma)LOC100781525 (gma)LOC100784236 (gma)LOC100788253 (gma)LOC100793406 (gma)LOC100797652 (gma)LOC100797894 (gma)LOC100798849 (gma)LOC100801608 (gma)TUBB2 (gma)LOC100816898 (gma)LOC100818878 (gma)LOC100819408 (gma)LOC100819883 (gma)LOC101246411 (sly)LOC101248630 (sly)LOC101248956 (sly)LOC101251552 (sly)LOC101252240 (sly)LOC101253952 (sly)LOC101262621 (sly)LOC101262728 (sly)LOC101265829 (sly)LOC103625832 (zma)LOC103629648 (zma)LOC103827910 (bra)LOC103832026 (bra)LOC103834176 (bra)LOC103839187 (bra)LOC103846653 (bra)LOC103848440 (bra)LOC103858467 (bra)LOC103861207 (bra)LOC103864974 (bra)LOC103867806 (bra)LOC103868027 (bra)LOC103873285 (bra)LOC103873591 (bra)LOC103873913 (bra)LOC103874246 (bra)LOC103874709 (bra)
Subcellular
localization
wolf
nucl 5,  cyto 3,  cysk_nucl 3  (predict for XP_002307960.1)
nucl 5,  cyto 3,  cysk_nucl 3  (predict for XP_006380970.1)
nucl 5,  cyto 3,  cysk_nucl 3  (predict for XP_024459838.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 8  (predict for XP_002307960.1)
other 8  (predict for XP_006380970.1)
other 8  (predict for XP_024459838.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
ppo04145 Phagosome 6
Genes directly connected with LOC7479658 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail
Entrez Gene ID*
7.5 LOC7464075 tubulin beta-5 chain [detail] 7464075
5.5 LOC7466778 filament-like plant protein 3 [detail] 7466778
5.4 LOC7478755 tubulin alpha chain [detail] 7478755
5.0 LOC7465144 calcium-dependent protein kinase 7 [detail] 7465144
4.7 LOC7488864 LIM domain-containing protein WLIM1 [detail] 7488864
4.5 LOC7477677 tubulin beta chain [detail] 7477677
3.9 LOC7466415 serine carboxypeptidase-like 42 [detail] 7466415
3.8 LOC7471053 14-3-3-like protein GF14 iota [detail] 7471053
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for LOC7479658]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 7479658    
Refseq ID (protein) XP_002307960.1 
XP_006380970.1 
XP_024459838.1 


The preparation time of this page was 0.2 [sec].