[][] ath   At5g23860 Gene
functional annotation
Function   tubulin beta 8
GO BP
GO:0007017 [list] [network] microtubule-based process  (134 genes)  ISS  
GO CC
GO:0045298 [list] [network] tubulin complex  (13 genes)  ISS  
GO:0005794 [list] [network] Golgi apparatus  (1182 genes)  HDA  
GO:0005829 [list] [network] cytosol  (2559 genes)  HDA  
GO:0005737 [list] [network] cytoplasm  (13880 genes)  ISM  
GO MF
GO:0005200 [list] [network] structural constituent of cytoskeleton  (24 genes)  ISS  
GO:0003729 [list] [network] mRNA binding  (1535 genes)  IDA  
GO:0005515 [list] [network] protein binding  (5066 genes)  IPI  
KEGG ath04145 [list] [network] Phagosome (83 genes)
Protein NP_001190373.1  NP_568437.1 
BLAST NP_001190373.1  NP_568437.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC543257 (tae)LOC543258 (tae)LOC543260 (tae)LOC543261 (tae)LOC543262 (tae)LOC543473 (tae)TUBB3 (gma)TUBB (gma)TUB (sly)TUB7 (ath)TUB9 (ath)TUB6 (ath)TUB4 (ath)TUB2 (ath)TUB3 (ath)TUB5 (ath)TUB1 (ath)LOC4326917 (osa)LOC4327550 (osa)LOC4328420 (osa)LOC4331315 (osa)LOC4333632 (osa)LOC4334309 (osa)LOC4338790 (osa)LOC4341810 (osa)LOC7454884 (ppo)LOC7462497 (ppo)LOC7464075 (ppo)LOC7465852 (ppo)LOC7465861 (ppo)LOC7468015 (ppo)LOC7471684 (ppo)LOC7472769 (ppo)LOC7477677 (ppo)LOC7478050 (ppo)LOC7479116 (ppo)LOC7479658 (ppo)LOC7480106 (ppo)LOC7481503 (ppo)LOC7486729 (ppo)LOC7487287 (ppo)LOC7487442 (ppo)LOC11414871 (mtr)LOC11415767 (mtr)LOC11422693 (mtr)LOC11425110 (mtr)LOC11437601 (mtr)LOC11438618 (mtr)LOC11439086 (mtr)LOC11442516 (mtr)LOC18095120 (ppo)LOC18103507 (ppo)LOC18108966 (ppo)LOC25491473 (mtr)LOC25493371 (mtr)TUBB1 (gma)LOC100781043 (gma)LOC100781525 (gma)LOC100784236 (gma)LOC100788253 (gma)LOC100793406 (gma)LOC100797652 (gma)LOC100797894 (gma)LOC100798849 (gma)LOC100801608 (gma)LOC100801893 (gma)TUBB2 (gma)LOC100816898 (gma)LOC100818878 (gma)LOC100819408 (gma)LOC100819883 (gma)LOC101246411 (sly)LOC101248630 (sly)LOC101248956 (sly)LOC101251552 (sly)LOC101252240 (sly)LOC101253952 (sly)LOC101262621 (sly)LOC101262728 (sly)LOC101265829 (sly)LOC103827910 (bra)LOC103832026 (bra)LOC103834176 (bra)LOC103839187 (bra)LOC103846653 (bra)LOC103848440 (bra)LOC103858467 (bra)LOC103861207 (bra)LOC103864974 (bra)LOC103867806 (bra)LOC103868027 (bra)LOC103873285 (bra)LOC103873591 (bra)LOC103873913 (bra)LOC103874246 (bra)LOC103874709 (bra)LOC112324443 (ppo)LOC121173566 (gma)LOC123038379 (tae)LOC123055669 (tae)LOC123062345 (tae)LOC123071115 (tae)LOC123087340 (tae)LOC123093905 (tae)LOC123095632 (tae)LOC123099112 (tae)LOC123102397 (tae)LOC123105255 (tae)LOC123105434 (tae)LOC123106070 (tae)LOC123113513 (tae)LOC123132419 (tae)LOC123132824 (tae)LOC123136498 (tae)LOC123137750 (tae)LOC123149111 (tae)LOC123156491 (tae)LOC123168888 (tae)LOC123182447 (tae)LOC123405951 (hvu)LOC123408330 (hvu)LOC123413646 (hvu)LOC123442982 (hvu)LOC123444074 (hvu)LOC123444643 (hvu)LOC123446959 (hvu)LOC123449966 (hvu)LOC123452511 (hvu)
Subcellular
localization
wolf
nucl 4,  cyto 3,  chlo 2,  nucl_plas 2  (predict for NP_001190373.1)
nucl 4,  cyto 3,  chlo 2,  nucl_plas 2  (predict for NP_568437.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 8  (predict for NP_001190373.1)
other 8  (predict for NP_568437.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
ath04145 Phagosome 8
Genes directly connected with TUB8 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
8.4 TUB6 beta-6 tubulin [detail] 831100
7.1 AT5G16590 Leucine-rich repeat protein kinase family protein [detail] 831521
6.7 TUA6 Tubulin/FtsZ family protein [detail] 827154
5.4 AT1G56720 Protein kinase superfamily protein [detail] 842128
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for TUB8]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
249818_at
249818_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
249818_at
249818_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
249818_at
249818_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 832451    
Refseq ID (protein) NP_001190373.1 
NP_568437.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].