[←][→] mtr   MTR_7g097030 Gene
functional annotation
Function   protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 4      
GO BP
GO CC
GO MF
KEGG
Protein XP_013449906.1  XP_024625801.1 
BLAST XP_013449906.1  XP_024625801.1 
Orthologous [Ortholog page] LSH3 (ath)  LSH10 (ath)  LSH2 (ath)  LSH4 (ath)  LSH1 (ath)  LSH6 (ath)  LSH8 (ath)  LSH7 (ath)  LOC4328416 (osa)  LOC4330024 (osa)  LOC4331099 (osa)  LOC4336401 (osa)  LOC4338491 (osa)  LOC4341811 (osa)  LOC7454352 (ppo)  LOC7455905 (ppo)  LOC7455945 (ppo)  LOC7458006 (ppo)  LOC7458242 (ppo)  LOC7460096 (ppo)  LOC7467540 (ppo)  LOC7470206 (ppo)  LOC7471962 (ppo)  LOC7474992 (ppo)  LOC7480386 (ppo)  LOC7487181 (ppo)  LOC7487704 (ppo)  LOC7489106 (ppo)  LOC7496798 (ppo)  LOC9266624 (osa)  LOC11407427 (mtr)  LOC11408401 (mtr)  LOC11408456 (mtr)  LOC11409774 (mtr)  LOC11410018 (mtr)  LOC11410358 (mtr)  LOC11419093 (mtr)  LOC11434608 (mtr)  LOC18095487 (ppo)  LOC18102467 (ppo)  LOC25484251 (mtr)  LOC25485780 (mtr)  LOC25485963 (mtr)  LOC25493337 (mtr)  LOC25499718 (mtr)  LSH9 (ath)  LSH5 (ath)  LOC100306082 (gma)  LOC100306225 (gma)  LOC100527164 (gma)  LOC100527409 (gma)  LOC100527554 (gma)  LOC100775798 (gma)  LOC100775838 (gma)  LOC100778283 (gma)  LOC100778886 (gma)  LOC100780494 (gma)  LOC100786135 (gma)  LOC100789834 (gma)  LOC100791424 (gma)  LOC100802715 (gma)  LOC100802937 (gma)  LOC100803605 (gma)  LOC100803965 (gma)  LOC100806134 (gma)  LOC100806493 (gma)  LOC100806497 (gma)  LOC100810350 (gma)  LOC100810655 (gma)  LOC100815968 (gma)  TFAM1 (sly)  LOC101244207 (sly)  LOC101246185 (sly)  LOC101247206 (sly)  TFAM2 (sly)  LOC101252299 (sly)  LOC101253723 (sly)  LOC101256738 (sly)  LOC101260873 (sly)  LOC101261831 (sly)  LOC101262247 (sly)  LOC101263979 (sly)  LOC102663941 (gma)  LOC103828755 (bra)  LOC103832357 (bra)  LOC103837296 (bra)  LOC103843480 (bra)  LOC103843985 (bra)  LOC103845278 (bra)  LOC103845279 (bra)  LOC103848911 (bra)  LOC103850046 (bra)  LOC103851635 (bra)  LOC103853147 (bra)  LOC103853659 (bra)  LOC103854635 (bra)  LOC103858024 (bra)  LOC103859037 (bra)  LOC103861005 (bra)  LOC103865110 (bra)  LOC103865960 (bra)  LOC103866652 (bra)  LOC103867894 (bra)  LOC103867981 (bra)  LOC103874577 (bra)  LOC107276238 (osa)  LOC107278201 (osa)  LOC107278610 (osa)  LOC117125638 (bra)  LOC123041251 (tae)  LOC123045668 (tae)  LOC123046119 (tae)  LOC123049257 (tae)  LOC123052627 (tae)  LOC123053999 (tae)  LOC123058740 (tae)  LOC123074939 (tae)  LOC123127737 (tae)  LOC123128934 (tae)  LOC123136756 (tae)  LOC123137510 (tae)  LOC123144860 (tae)  LOC123146052 (tae)  LOC123149104 (tae)  LOC123159994 (tae)  LOC123166451 (tae)  LOC123181080 (tae)  LOC123181711 (tae)  LOC123185303 (tae)  LOC123189888 (tae)  LOC123402509 (hvu)  LOC123403258 (hvu)  LOC123409615 (hvu)  LOC123411667 (hvu)  LOC123412451 (hvu)  LOC123427243 (hvu)  LOC123430078 (hvu)  LOC123440575 (hvu)  LOC123444893 (hvu) 
Subcellular
localization
wolf
nucl 10  (predict for XP_013449906.1)
nucl 10  (predict for XP_024625801.1)
Subcellular
localization
TargetP
chlo 6,  other 4  (predict for XP_013449906.1)
chlo 6,  other 4  (predict for XP_024625801.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with LOC25499270 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
4.5 LOC11434608 protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 4 [detail] 11434608
4.5 LOC11411279 protein NRT1/ PTR FAMILY 5.1 [detail] 11411279
4.3 LOC25483282 BTB/POZ domain and ankyrin repeat-containing protein NOOT2-like [detail] 25483282
3.3 LOC25491151 transcription factor bHLH137 [detail] 25491151
3.1 LOC11406968 uncharacterized LOC11406968 [detail] 11406968
Coexpressed
gene list		 [Coexpressed gene list for LOC25499270]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 25499270      
Refseq ID (protein) XP_013449906.1 
XP_024625801.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].