[][] ppo   POPTR_019G018600v3 Gene
functional annotation
Function   protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 1
GO BP
GO CC
GO MF
KEGG
Protein XP_002325335.2 
BLAST XP_002325335.2 
Orthologous [Ortholog page] LSH3 (ath)LSH10 (ath)LSH2 (ath)LSH4 (ath)LSH1 (ath)LSH6 (ath)LSH8 (ath)LSH7 (ath)LOC4328416 (osa)LOC4330024 (osa)LOC4331099 (osa)LOC4336401 (osa)LOC4338491 (osa)LOC4341811 (osa)LOC7454352 (ppo)LOC7455905 (ppo)LOC7455945 (ppo)LOC7458006 (ppo)LOC7458242 (ppo)LOC7460096 (ppo)LOC7467540 (ppo)LOC7470206 (ppo)LOC7471962 (ppo)LOC7474992 (ppo)LOC7480386 (ppo)LOC7487704 (ppo)LOC7489106 (ppo)LOC7496798 (ppo)LOC9266624 (osa)LOC11407427 (mtr)LOC11408401 (mtr)LOC11408456 (mtr)LOC11409774 (mtr)LOC11410018 (mtr)LOC11410358 (mtr)LOC11419093 (mtr)LOC11434608 (mtr)LOC18095487 (ppo)LOC18102467 (ppo)LOC25484251 (mtr)LOC25485780 (mtr)LOC25485963 (mtr)LOC25493337 (mtr)LOC25499270 (mtr)LOC25499718 (mtr)LSH9 (ath)LSH5 (ath)LOC100306082 (gma)LOC100306225 (gma)LOC100527164 (gma)LOC100527409 (gma)LOC100527554 (gma)LOC100775798 (gma)LOC100775838 (gma)LOC100778283 (gma)LOC100778886 (gma)LOC100780494 (gma)LOC100786135 (gma)LOC100789834 (gma)LOC100791424 (gma)LOC100802715 (gma)LOC100802937 (gma)LOC100803605 (gma)LOC100803965 (gma)LOC100806134 (gma)LOC100806493 (gma)LOC100806497 (gma)LOC100810350 (gma)LOC100810655 (gma)LOC100815968 (gma)TFAM1 (sly)LOC101244207 (sly)LOC101246185 (sly)LOC101247206 (sly)TFAM2 (sly)LOC101252299 (sly)LOC101253723 (sly)LOC101256738 (sly)LOC101260873 (sly)LOC101261831 (sly)LOC101262247 (sly)LOC101263979 (sly)LOC102663941 (gma)LOC103828755 (bra)LOC103832357 (bra)LOC103837296 (bra)LOC103843480 (bra)LOC103843985 (bra)LOC103845278 (bra)LOC103845279 (bra)LOC103848911 (bra)LOC103850046 (bra)LOC103851635 (bra)LOC103853147 (bra)LOC103853659 (bra)LOC103854635 (bra)LOC103858024 (bra)LOC103859037 (bra)LOC103861005 (bra)LOC103865110 (bra)LOC103865960 (bra)LOC103866652 (bra)LOC103867894 (bra)LOC103867981 (bra)LOC103874577 (bra)LOC107276238 (osa)LOC107278201 (osa)LOC107278610 (osa)LOC117125638 (bra)LOC123041251 (tae)LOC123045668 (tae)LOC123046119 (tae)LOC123049257 (tae)LOC123052627 (tae)LOC123053999 (tae)LOC123058740 (tae)LOC123074939 (tae)LOC123127737 (tae)LOC123128934 (tae)LOC123136756 (tae)LOC123137510 (tae)LOC123144860 (tae)LOC123146052 (tae)LOC123149104 (tae)LOC123159994 (tae)LOC123166451 (tae)LOC123181080 (tae)LOC123181711 (tae)LOC123185303 (tae)LOC123189888 (tae)LOC123402509 (hvu)LOC123403258 (hvu)LOC123409615 (hvu)LOC123411667 (hvu)LOC123412451 (hvu)LOC123427243 (hvu)LOC123430078 (hvu)LOC123440575 (hvu)LOC123444893 (hvu)
Subcellular
localization
wolf
chlo 9  (predict for XP_002325335.2)
Subcellular
localization
TargetP
chlo 9,  other 4  (predict for XP_002325335.2)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with LOC7487181 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
9.3 LOC7487704 protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 1 [detail] 7487704
7.1 LOC7467540 protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 4 [detail] 7467540
6.7 LOC7467239 homeobox protein knotted-1-like 2 [detail] 7467239
5.8 LOC18102467 protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 4 [detail] 18102467
4.4 LOC7479057 cilia- and flagella-associated protein 58 [detail] 7479057
4.2 LOC18102133 uncharacterized LOC18102133 [detail] 18102133
4.0 LOC7468990 uncharacterized LOC7468990 [detail] 7468990
3.8 LOC7476711 uncharacterized LOC7476711 [detail] 7476711
3.8 LOC18095487 protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 7 [detail] 18095487
3.7 LOC7477073 uncharacterized LOC7477073 [detail] 7477073
3.5 LOC7459982 uncharacterized LOC7459982 [detail] 7459982
3.3 LOC7458006 protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 10 [detail] 7458006
3.2 LOC7493233 putative cyclic nucleotide-gated ion channel 7 [detail] 7493233
3.1 LOC7453985 uncharacterized LOC7453985 [detail] 7453985
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for LOC7487181]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 7487181    
Refseq ID (protein) XP_002325335.2 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].