[][] gma   GLYMA_12G138800 Gene
functional annotation
Function   (-)-germacrene D synthase
GO BP
GO CC
GO MF
KEGG gmx00909 [list] [network] Sesquiterpenoid and triterpenoid biosynthesis (27 genes)
Protein XP_025980403.1 
BLAST XP_025980403.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC542156 (zma)LOC542688 (zma)LOC542689 (zma)LOC542754 (zma)SSTLE1 (sly)LOC732751 (zma)LOC732795 (zma)LOC732834 (zma)AT2G23230 (ath)AT3G14490 (ath)AT3G14520 (ath)AT3G14540 (ath)AT3G29110 (ath)AT3G29190 (ath)AT3G29410 (ath)AT3G32030 (ath)TPS12 (ath)TPS13 (ath)TS1 (ath)AT4G20200 (ath)AT4G20210 (ath)AT4G20230 (ath)TPS21 (ath)AT5G48110 (ath)AT1G31950 (ath)AT1G33750 (ath)AT1G48800 (ath)AT1G48820 (ath)AT1G66020 (ath)AT1G70080 (ath)LOC4326845 (osa)LOC4332831 (osa)LOC4332889 (osa)LOC4332893 (osa)LOC4332895 (osa)LOC4333167 (osa)LOC4335518 (osa)LOC4335522 (osa)LOC4335526 (osa)LOC4335529 (osa)LOC4344635 (osa)LOC4344755 (osa)LOC7454979 (ppo)LOC7457170 (ppo)LOC7457783 (ppo)LOC9267045 (osa)LOC9267316 (osa)LOC9270657 (osa)LOC9272299 (osa)LOC11405529 (mtr)LOC11407907 (mtr)LOC11411115 (mtr)LOC11416693 (mtr)LOC11421083 (mtr)LOC11426332 (mtr)LOC11432484 (mtr)LOC25490897 (mtr)LOC25491517 (mtr)LOC25492138 (mtr)LOC25492939 (mtr)LOC25496253 (mtr)LOC25500131 (mtr)LOC100125649 (zma)LOC100232954 (vvi)VALCS (vvi)LOC100241381 (vvi)LOC100241480 (vvi)LOC100241877 (vvi)LOC100243606 (vvi)LOC100246608 (vvi)LOC100249970 (vvi)LOC100252140 (vvi)LOC100255553 (vvi)LOC100256880 (vvi)LOC100257265 (vvi)LOC100258596 (vvi)LOC100260112 (vvi)GERA (vvi)LOC100260629 (vvi)LOC100260714 (vvi)LOC100261959 (vvi)LOC100261963 (vvi)LOC100263746 (vvi)LOC100264159 (vvi)LOC100265509 (vvi)LOC100267137 (vvi)LOC100267145 (vvi)LOC100267551 (vvi)LOC100273678 (zma)LOC100281754 (zma)TPS19 (gma)TPS16 (gma)TPS10 (gma)TPS11 (gma)TPS13 (gma)TPS31 (sly)TPS17 (sly)TPS16 (sly)LOC101245838 (sly)TPS14 (sly)TPS36 (sly)LOC101257190 (sly)LOC101258081 (sly)TPS28 (sly)TPS32 (sly)TPS33 (sly)TPS35 (sly)LOC103629258 (zma)LOC103641097 (zma)LOC103641099 (zma)LOC103641105 (zma)LOC103641187 (zma)LOC103641226 (zma)LOC103646867 (zma)LOC103834122 (bra)LOC103834164 (bra)LOC103838683 (bra)LOC103839120 (bra)LOC103841971 (bra)LOC103841981 (bra)LOC103842000 (bra)LOC103844604 (bra)LOC103845195 (bra)LOC103848456 (bra)LOC103849526 (bra)LOC103849591 (bra)LOC103859578 (bra)LOC103859580 (bra)LOC103860598 (bra)LOC103861083 (bra)LOC103861084 (bra)LOC103862704 (bra)LOC103863851 (bra)LOC103864213 (bra)LOC103874257 (bra)LOC103874801 (bra)TPS12 (sly)LOC104648119 (sly)LOC107275762 (osa)LOC107276422 (osa)LOC107276496 (osa)LOC107277636 (osa)LOC107277734 (osa)LOC107278021 (osa)LOC107278125 (osa)LOC107278693 (osa)LOC107280712 (osa)LOC107280931 (osa)LOC107280950 (osa)LOC108870167 (bra)LOC109941320 (zma)LOC109943031 (zma)LOC109943306 (zma)
Subcellular
localization
wolf
mito 2,  chlo 2,  cyto 2,  mito_plas 1,  pero 1,  cyto_nucl 1,  cyto_E.R. 1  (predict for XP_025980403.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 5,  chlo 5  (predict for XP_025980403.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
gma00909 Sesquiterpenoid and triterpenoid biosynthesis 2
Genes directly connected with LOC100802427 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail
Entrez Gene ID*
14.8 TPS10 terpene synthase 10 [detail] 100798701
3.9 LOC100816162 uncharacterized LOC100816162 [detail] 100816162
3.8 LOC100794527 ABC transporter G family member 2 [detail] 100794527
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for LOC100802427]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 100802427    
Refseq ID (protein) XP_025980403.1 


The preparation time of this page was 0.2 [sec].