[←][→] sly   101258081 Gene
functional annotation
Function   (-)-germacrene D synthase  
GO BP
GO CC
GO MF
KEGG sly00909 [list] [network] Sesquiterpenoid and triterpenoid biosynthesis (28 genes)
Protein XP_019070211.1 
BLAST XP_019070211.1 
Orthologous [Ortholog page] LOC542156 (zma)  LOC542688 (zma)  LOC542689 (zma)  LOC542754 (zma)  SSTLE1 (sly)  LOC732751 (zma)  LOC732795 (zma)  LOC732834 (zma)  AT2G23230 (ath)  AT3G14490 (ath)  AT3G14520 (ath)  AT3G14540 (ath)  AT3G29110 (ath)  AT3G29190 (ath)  AT3G29410 (ath)  AT3G32030 (ath)  TPS12 (ath)  TPS13 (ath)  TS1 (ath)  AT4G20200 (ath)  AT4G20210 (ath)  AT4G20230 (ath)  TPS21 (ath)  AT5G48110 (ath)  AT1G31950 (ath)  AT1G33750 (ath)  AT1G48800 (ath)  AT1G48820 (ath)  AT1G66020 (ath)  AT1G70080 (ath)  LOC4326845 (osa)  LOC4332831 (osa)  LOC4332889 (osa)  LOC4332893 (osa)  LOC4332895 (osa)  LOC4333167 (osa)  LOC4335518 (osa)  LOC4335522 (osa)  LOC4335526 (osa)  LOC4335529 (osa)  LOC4344635 (osa)  LOC4344755 (osa)  LOC7454979 (ppo)  LOC7457170 (ppo)  LOC7457783 (ppo)  LOC9267045 (osa)  LOC9267316 (osa)  LOC9270657 (osa)  LOC9272299 (osa)  LOC11405529 (mtr)  LOC11407907 (mtr)  LOC11411115 (mtr)  LOC11416693 (mtr)  LOC11421083 (mtr)  LOC11426332 (mtr)  LOC11432484 (mtr)  LOC25490897 (mtr)  LOC25491517 (mtr)  LOC25492138 (mtr)  LOC25492939 (mtr)  LOC25496253 (mtr)  LOC25500131 (mtr)  LOC100125649 (zma)  LOC100232954 (vvi)  VALCS (vvi)  LOC100241381 (vvi)  LOC100241480 (vvi)  LOC100241877 (vvi)  LOC100243606 (vvi)  LOC100246608 (vvi)  LOC100249970 (vvi)  LOC100252140 (vvi)  LOC100255553 (vvi)  LOC100256880 (vvi)  LOC100257265 (vvi)  LOC100258596 (vvi)  LOC100260112 (vvi)  GERA (vvi)  LOC100260629 (vvi)  LOC100260714 (vvi)  LOC100261959 (vvi)  LOC100261963 (vvi)  LOC100263746 (vvi)  LOC100264159 (vvi)  LOC100265509 (vvi)  LOC100267137 (vvi)  LOC100267145 (vvi)  LOC100267551 (vvi)  LOC100273678 (zma)  LOC100281754 (zma)  TPS19 (gma)  TPS16 (gma)  TPS10 (gma)  TPS11 (gma)  LOC100802427 (gma)  TPS13 (gma)  TPS31 (sly)  TPS17 (sly)  TPS16 (sly)  LOC101245838 (sly)  TPS14 (sly)  TPS36 (sly)  LOC101257190 (sly)  TPS28 (sly)  TPS32 (sly)  TPS33 (sly)  TPS35 (sly)  LOC103629258 (zma)  LOC103641097 (zma)  LOC103641099 (zma)  LOC103641105 (zma)  LOC103641187 (zma)  LOC103641226 (zma)  LOC103646867 (zma)  LOC103834122 (bra)  LOC103834164 (bra)  LOC103838683 (bra)  LOC103839120 (bra)  LOC103841971 (bra)  LOC103841981 (bra)  LOC103842000 (bra)  LOC103844604 (bra)  LOC103845195 (bra)  LOC103848456 (bra)  LOC103849526 (bra)  LOC103849591 (bra)  LOC103859578 (bra)  LOC103859580 (bra)  LOC103860598 (bra)  LOC103861083 (bra)  LOC103861084 (bra)  LOC103862704 (bra)  LOC103863851 (bra)  LOC103864213 (bra)  LOC103874257 (bra)  LOC103874801 (bra)  TPS12 (sly)  LOC104648119 (sly)  LOC107275762 (osa)  LOC107276422 (osa)  LOC107276496 (osa)  LOC107277636 (osa)  LOC107277734 (osa)  LOC107278021 (osa)  LOC107278125 (osa)  LOC107278693 (osa)  LOC107280712 (osa)  LOC107280931 (osa)  LOC107280950 (osa)  LOC108870167 (bra)  LOC109941320 (zma)  LOC109943031 (zma)  LOC109943306 (zma) 
Subcellular
localization
wolf
cyto 6,  cysk 3  (predict for XP_019070211.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 7,  mito 3  (predict for XP_019070211.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
sly01230 Biosynthesis of amino acids 2
sly03008 Ribosome biogenesis in eukaryotes 2
Genes directly connected with LOC101258081 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail		 Entrez Gene ID*
3.1 LOC101266192 vesicle-associated protein 4-1 [detail] 101266192
3.1 LOC101265001 RING-H2 finger protein ATL57 [detail] 101265001
3.0 LOC101245066 2-isopropylmalate synthase B [detail] 101245066
Coexpressed
gene list		 [Coexpressed gene list for LOC101258081]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 101258081      
Refseq ID (protein) XP_019070211.1 


The preparation time of this page was 1.0 [sec].