[←][→] gma   GLYMA_16G199700 Gene
functional annotation
Function   pentatricopeptide repeat-containing protein At1g62930, chloroplastic  
GO BP
GO CC
GO MF
KEGG
Protein XP_003549125.1  XP_014624499.1 
BLAST XP_003549125.1  XP_014624499.1 
Orthologous [Ortholog page] AT3G16710 (ath)  AT3G22470 (ath)  AT4G26800 (ath)  AT5G16640 (ath)  AT5G41170 (ath)  AT1G06580 (ath)  AT1G12300 (ath)  AT1G12620 (ath)  RPF1 (ath)  AT1G62590 (ath)  RPF2 (ath)  AT1G62680 (ath)  NG1 (ath)  AT1G62910 (ath)  RPF3 (ath)  AT1G63070 (ath)  AT1G63080 (ath)  AT1G63130 (ath)  AT1G63150 (ath)  AT1G63330 (ath)  AT1G63400 (ath)  AT1G64580 (ath)  AT1G12775 (ath)  LOC7455414 (ppo)  LOC7465949 (ppo)  LOC7497413 (ppo)  AT1G62914 (ath)  AT1G64583 (ath)  LOC11409172 (mtr)  LOC11411617 (mtr)  LOC11411874 (mtr)  LOC11413784 (mtr)  LOC11414076 (mtr)  LOC11416151 (mtr)  LOC11417300 (mtr)  LOC11419137 (mtr)  LOC11419300 (mtr)  LOC11419320 (mtr)  LOC11420208 (mtr)  LOC11422222 (mtr)  LOC11430397 (mtr)  LOC11436467 (mtr)  LOC11439118 (mtr)  LOC25479607 (mtr)  LOC25479611 (mtr)  LOC25479678 (mtr)  LOC25480002 (mtr)  LOC25480323 (mtr)  LOC25480558 (mtr)  LOC25480855 (mtr)  LOC25481060 (mtr)  LOC25481299 (mtr)  LOC25481803 (mtr)  LOC25482431 (mtr)  LOC25483258 (mtr)  LOC25496585 (mtr)  LOC25496655 (mtr)  LOC25496724 (mtr)  LOC25496733 (mtr)  LOC25496736 (mtr)  LOC25496740 (mtr)  LOC25496751 (mtr)  LOC25496764 (mtr)  LOC25496765 (mtr)  LOC25497066 (mtr)  LOC25497290 (mtr)  LOC25497361 (mtr)  LOC100243276 (vvi)  LOC100244236 (vvi)  LOC100246659 (vvi)  LOC100252034 (vvi)  LOC100253509 (vvi)  LOC100255400 (vvi)  LOC100256928 (vvi)  LOC100258882 (vvi)  LOC100265584 (vvi)  LOC100777512 (gma)  LOC100777919 (gma)  LOC100778062 (gma)  LOC100778420 (gma)  LOC100781818 (gma)  LOC100793769 (gma)  LOC100795807 (gma)  LOC100796249 (gma)  LOC100807278 (gma)  LOC100811076 (gma)  LOC100811865 (gma)  LOC100812093 (gma)  LOC100813712 (gma)  LOC100818504 (gma)  LOC100852554 (vvi)  LOC101244875 (sly)  LOC101248205 (sly)  LOC101256290 (sly)  LOC101263217 (sly)  LOC101266330 (sly)  LOC102663208 (gma)  LOC102669831 (gma)  LOC103833524 (bra)  LOC103836144 (bra)  LOC103836146 (bra)  LOC103836151 (bra)  LOC103838039 (bra)  LOC103838041 (bra)  LOC103838174 (bra)  LOC103838255 (bra)  LOC103838258 (bra)  LOC103838282 (bra)  LOC103838376 (bra)  LOC103839829 (bra)  LOC103843088 (bra)  LOC103843103 (bra)  LOC103843107 (bra)  LOC103843127 (bra)  LOC103843546 (bra)  LOC103846313 (bra)  LOC103864061 (bra)  LOC103866658 (bra)  LOC103871206 (bra)  LOC104879278 (vvi)  LOC106796589 (gma)  LOC112417994 (mtr)  LOC112422668 (mtr)  LOC112999808 (gma) 
Subcellular
localization
wolf
chlo 4,  chlo_mito 4,  mito 3,  plas 1,  extr 1,  E.R. 1,  E.R._plas 1  (predict for XP_003549125.1)
chlo 4,  chlo_mito 4,  mito 3,  plas 1,  extr 1,  E.R. 1,  E.R._plas 1  (predict for XP_014624499.1)
Subcellular
localization
TargetP
mito 6  (predict for XP_003549125.1)
mito 6  (predict for XP_014624499.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
gma03040 Spliceosome 2
Genes directly connected with LOC100789435 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail		 Entrez Gene ID*
5.9 LOC112999361 uncharacterized LOC112999361 [detail] 112999361
5.9 LOC100775851 protein PAF1 homolog [detail] 100775851
5.5 LOC102670038 uncharacterized LOC102670038 [detail] 102670038
4.0 LOC100785769 mitochondrial Rho GTPase 2 [detail] 100785769
3.8 LOC100813712 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g12775, mitochondrial [detail] 100813712
Coexpressed
gene list		 [Coexpressed gene list for LOC100789435]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 100789435      
Refseq ID (protein) XP_003549125.1 
XP_014624499.1 


The preparation time of this page was 0.2 [sec].