[][] mtr   MTR_1g045850 Gene
functional annotation
Function   pentatricopeptide repeat-containing protein At1g12300, mitochondrial
GO BP
GO CC
GO MF
KEGG
Protein XP_003590199.3  XP_024632646.1  XP_024632651.1 
BLAST XP_003590199.3  XP_024632646.1  XP_024632651.1 
Orthologous [Ortholog page] AT3G16710 (ath)AT3G22470 (ath)AT4G26800 (ath)AT5G16640 (ath)AT5G41170 (ath)AT1G06580 (ath)AT1G12300 (ath)AT1G12620 (ath)RPF1 (ath)AT1G62590 (ath)RPF2 (ath)AT1G62680 (ath)NG1 (ath)AT1G62910 (ath)RPF3 (ath)AT1G63070 (ath)AT1G63080 (ath)AT1G63130 (ath)AT1G63150 (ath)AT1G63330 (ath)AT1G63400 (ath)AT1G64580 (ath)AT1G12775 (ath)LOC7455414 (ppo)LOC7465949 (ppo)LOC7497413 (ppo)AT1G62914 (ath)AT1G64583 (ath)LOC11409172 (mtr)LOC11411617 (mtr)LOC11411874 (mtr)LOC11413784 (mtr)LOC11414076 (mtr)LOC11416151 (mtr)LOC11417300 (mtr)LOC11419137 (mtr)LOC11419300 (mtr)LOC11419320 (mtr)LOC11420208 (mtr)LOC11422222 (mtr)LOC11436467 (mtr)LOC11439118 (mtr)LOC25479607 (mtr)LOC25479611 (mtr)LOC25479678 (mtr)LOC25480002 (mtr)LOC25480323 (mtr)LOC25480558 (mtr)LOC25480855 (mtr)LOC25481060 (mtr)LOC25481299 (mtr)LOC25481803 (mtr)LOC25482431 (mtr)LOC25483258 (mtr)LOC25496585 (mtr)LOC25496655 (mtr)LOC25496724 (mtr)LOC25496733 (mtr)LOC25496736 (mtr)LOC25496740 (mtr)LOC25496751 (mtr)LOC25496764 (mtr)LOC25496765 (mtr)LOC25497066 (mtr)LOC25497290 (mtr)LOC25497361 (mtr)LOC100243276 (vvi)LOC100244236 (vvi)LOC100246659 (vvi)LOC100252034 (vvi)LOC100253509 (vvi)LOC100255400 (vvi)LOC100256928 (vvi)LOC100258882 (vvi)LOC100265584 (vvi)LOC100777512 (gma)LOC100777919 (gma)LOC100778062 (gma)LOC100778420 (gma)LOC100781818 (gma)LOC100789435 (gma)LOC100793769 (gma)LOC100795807 (gma)LOC100796249 (gma)LOC100807278 (gma)LOC100811076 (gma)LOC100811865 (gma)LOC100812093 (gma)LOC100813712 (gma)LOC100818504 (gma)LOC100852554 (vvi)LOC101244875 (sly)LOC101248205 (sly)LOC101256290 (sly)LOC101263217 (sly)LOC101266330 (sly)LOC102663208 (gma)LOC102669831 (gma)LOC103833524 (bra)LOC103836144 (bra)LOC103836146 (bra)LOC103836151 (bra)LOC103838039 (bra)LOC103838041 (bra)LOC103838174 (bra)LOC103838255 (bra)LOC103838258 (bra)LOC103838282 (bra)LOC103838376 (bra)LOC103839829 (bra)LOC103843088 (bra)LOC103843103 (bra)LOC103843107 (bra)LOC103843127 (bra)LOC103843546 (bra)LOC103846313 (bra)LOC103864061 (bra)LOC103866658 (bra)LOC103871206 (bra)LOC104879278 (vvi)LOC106796589 (gma)LOC112417994 (mtr)LOC112422668 (mtr)LOC112999808 (gma)
Subcellular
localization
wolf
chlo 5,  mito 1,  extr 1,  nucl 1,  E.R. 1,  pero 1,  cyto_mito 1,  mito_plas 1  (predict for XP_003590199.3)
chlo 5,  mito 1,  extr 1,  nucl 1,  E.R. 1,  pero 1,  cyto_mito 1,  mito_plas 1  (predict for XP_024632646.1)
chlo 5,  mito 1,  extr 1,  nucl 1,  E.R. 1,  pero 1,  cyto_mito 1,  mito_plas 1  (predict for XP_024632651.1)
Subcellular
localization
TargetP
scret 2  (predict for XP_003590199.3)
scret 2  (predict for XP_024632646.1)
scret 2  (predict for XP_024632651.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
mtr00562 Inositol phosphate metabolism 2
Genes directly connected with LOC11430397 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail
Entrez Gene ID*
5.1 LOC25491767 phosphoinositide phosphatase SAC1 [detail] 25491767
4.8 LOC25491692 uncharacterized LOC25491692 [detail] 25491692
4.7 LOC25482653 pentatricopeptide repeat-containing protein At5g39710 [detail] 25482653
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for LOC11430397]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 11430397    
Refseq ID (protein) XP_003590199.3 
XP_024632646.1 
XP_024632651.1 


The preparation time of this page was 0.8 [sec].