[←][→] ath   At1g12700 Gene
functional annotation
Function   RNA processing FACTOR  
GO BP
GO:0090617 [list] [network] mitochondrial mRNA 5'-end processing  (4 genes)  IEP  
GO:0080156 [list] [network] mitochondrial mRNA modification  (27 genes)  IMP  
GO CC
GO:0005739 [list] [network] mitochondrion  (4228 genes)  IMP ISM  
GO:0009507 [list] [network] chloroplast  (5004 genes)  ISM  
GO MF
KEGG
Protein NP_001318989.1  NP_001320720.1  NP_001320721.1 
BLAST NP_001318989.1  NP_001320720.1  NP_001320721.1 
Orthologous [Ortholog page] AT3G16710 (ath)  AT3G22470 (ath)  AT4G26800 (ath)  AT5G16640 (ath)  AT5G41170 (ath)  AT1G06580 (ath)  AT1G12300 (ath)  AT1G12620 (ath)  AT1G62590 (ath)  RPF2 (ath)  AT1G62680 (ath)  NG1 (ath)  AT1G62910 (ath)  RPF3 (ath)  AT1G63070 (ath)  AT1G63080 (ath)  AT1G63130 (ath)  AT1G63150 (ath)  AT1G63400 (ath)  AT1G64580 (ath)  AT1G12775 (ath)  LOC7455414 (ppo)  LOC7459907 (ppo)  LOC7465949 (ppo)  LOC7473913 (ppo)  LOC7494521 (ppo)  LOC7497413 (ppo)  AT1G62914 (ath)  AT1G64583 (ath)  LOC11409172 (mtr)  LOC11411874 (mtr)  LOC11413784 (mtr)  LOC11414076 (mtr)  LOC11416151 (mtr)  LOC11417289 (mtr)  LOC11418245 (mtr)  LOC11419137 (mtr)  LOC11419320 (mtr)  LOC11420208 (mtr)  LOC11422222 (mtr)  LOC11422820 (mtr)  LOC11430397 (mtr)  LOC11436467 (mtr)  LOC11439118 (mtr)  LOC18097550 (ppo)  LOC18098827 (ppo)  LOC18098888 (ppo)  LOC18098897 (ppo)  LOC18098899 (ppo)  LOC18098911 (ppo)  LOC18098937 (ppo)  LOC18098938 (ppo)  LOC18098941 (ppo)  LOC18099092 (ppo)  LOC18100671 (ppo)  LOC18100718 (ppo)  LOC18104626 (ppo)  LOC18104675 (ppo)  LOC18106079 (ppo)  LOC18106937 (ppo)  LOC18107488 (ppo)  LOC18109035 (ppo)  LOC18110965 (ppo)  LOC18110967 (ppo)  LOC25479607 (mtr)  LOC25479611 (mtr)  LOC25479678 (mtr)  LOC25480002 (mtr)  LOC25480032 (mtr)  LOC25480855 (mtr)  LOC25481060 (mtr)  LOC25481299 (mtr)  LOC25481305 (mtr)  LOC25482431 (mtr)  LOC25483258 (mtr)  LOC25496655 (mtr)  LOC25496724 (mtr)  LOC25496736 (mtr)  LOC25496764 (mtr)  LOC25497066 (mtr)  LOC25497290 (mtr)  LOC25497361 (mtr)  AT1G12615 (ath)  LOC100777512 (gma)  LOC100777919 (gma)  LOC100778062 (gma)  LOC100778420 (gma)  LOC100781818 (gma)  LOC100782898 (gma)  LOC100786237 (gma)  LOC100786599 (gma)  LOC100789435 (gma)  LOC100793769 (gma)  LOC100794739 (gma)  LOC100796249 (gma)  LOC100807278 (gma)  LOC100808007 (gma)  LOC100811076 (gma)  LOC100811865 (gma)  LOC100812093 (gma)  LOC100812458 (gma)  LOC100812993 (gma)  LOC100813712 (gma)  LOC100814966 (gma)  LOC100818504 (gma)  LOC100818857 (gma)  LOC100819931 (gma)  LOC100820602 (gma)  LOC101244875 (sly)  LOC101248205 (sly)  LOC101256290 (sly)  LOC101263217 (sly)  LOC101266330 (sly)  LOC102663208 (gma)  LOC102663951 (gma)  LOC102668851 (gma)  LOC102669963 (gma)  LOC103833524 (bra)  LOC103836144 (bra)  LOC103836146 (bra)  LOC103836151 (bra)  LOC103838039 (bra)  LOC103838041 (bra)  LOC103838174 (bra)  LOC103838255 (bra)  LOC103838258 (bra)  LOC103838282 (bra)  LOC103838333 (bra)  LOC103838376 (bra)  LOC103838525 (bra)  LOC103839829 (bra)  LOC103843088 (bra)  LOC103843103 (bra)  LOC103843107 (bra)  LOC103843127 (bra)  LOC103843546 (bra)  LOC103846313 (bra)  LOC103864061 (bra)  LOC103866658 (bra)  LOC103871206 (bra)  LOC106794624 (gma)  LOC106796589 (gma)  LOC106799227 (gma)  LOC112327322 (ppo)  LOC112327523 (ppo)  LOC112327640 (ppo)  LOC112417994 (mtr)  LOC112997677 (gma)  LOC112999808 (gma)  LOC120575769 (mtr)  LOC120576066 (mtr)  LOC120576067 (mtr)  LOC120576109 (mtr)  LOC120576111 (mtr)  LOC120576112 (mtr)  LOC120576114 (mtr)  LOC120576116 (mtr)  LOC120576117 (mtr)  LOC120580925 (mtr)  LOC121173775 (gma) 
Subcellular
localization
wolf
chlo 8,  chlo_mito 5,  mito 1  (predict for NP_001318989.1)
nucl 6,  cyto 2,  chlo 1  (predict for NP_001320720.1)
nucl 6,  cyto 2,  chlo 1  (predict for NP_001320721.1)
Subcellular
localization
TargetP
mito 7  (predict for NP_001318989.1)
other 4,  chlo 3  (predict for NP_001320720.1)
other 4,  chlo 3  (predict for NP_001320721.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with RPF1 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
7.0 AT1G62680 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein [detail] 842565
6.9 AT1G62910 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein [detail] 842592
6.1 AT5G46100 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein [detail] 834651
5.0 AT4G18375 RNA-binding KH domain-containing protein [detail] 827566
Coexpressed
gene list		 [Coexpressed gene list for RPF1]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
255935_at
255935_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
255935_at
255935_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
AtGenExpress*
(Hormone)
255935_at
255935_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.
Link to other DBs
Entrez Gene ID 837825      
Refseq ID (protein) NP_001318989.1 
NP_001320720.1 
NP_001320721.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].