[][] ath   At1g62590 Gene
functional annotation
Function   pentatricopeptide (PPR) repeat-containing protein
GO BP
GO CC
GO:0009507 [list] [network] chloroplast  (5004 genes)  ISM  
GO MF
GO:0004016 [list] [network] adenylate cyclase activity  (4 genes)  IDA  
KEGG
Protein NP_001322835.1  NP_176447.1 
BLAST NP_001322835.1  NP_176447.1 
Orthologous [Ortholog page] AT3G16710 (ath)AT3G22470 (ath)AT4G26800 (ath)AT5G16640 (ath)AT5G41170 (ath)AT1G06580 (ath)AT1G12300 (ath)AT1G12620 (ath)RPF1 (ath)RPF2 (ath)AT1G62680 (ath)NG1 (ath)AT1G62910 (ath)RPF3 (ath)AT1G63070 (ath)AT1G63080 (ath)AT1G63130 (ath)AT1G63150 (ath)AT1G63400 (ath)AT1G64580 (ath)AT1G12775 (ath)LOC7455414 (ppo)LOC7459907 (ppo)LOC7465949 (ppo)LOC7473913 (ppo)LOC7494521 (ppo)LOC7497413 (ppo)AT1G62914 (ath)AT1G64583 (ath)LOC11409172 (mtr)LOC11411874 (mtr)LOC11413784 (mtr)LOC11414076 (mtr)LOC11416151 (mtr)LOC11417289 (mtr)LOC11418245 (mtr)LOC11419137 (mtr)LOC11419320 (mtr)LOC11420208 (mtr)LOC11422222 (mtr)LOC11422820 (mtr)LOC11430397 (mtr)LOC11436467 (mtr)LOC11439118 (mtr)LOC18097550 (ppo)LOC18098827 (ppo)LOC18098888 (ppo)LOC18098897 (ppo)LOC18098899 (ppo)LOC18098911 (ppo)LOC18098937 (ppo)LOC18098938 (ppo)LOC18098941 (ppo)LOC18099092 (ppo)LOC18100671 (ppo)LOC18100718 (ppo)LOC18104626 (ppo)LOC18104675 (ppo)LOC18106079 (ppo)LOC18106937 (ppo)LOC18107488 (ppo)LOC18109035 (ppo)LOC18110965 (ppo)LOC18110967 (ppo)LOC25479607 (mtr)LOC25479611 (mtr)LOC25479678 (mtr)LOC25480002 (mtr)LOC25480032 (mtr)LOC25480855 (mtr)LOC25481060 (mtr)LOC25481299 (mtr)LOC25481305 (mtr)LOC25482431 (mtr)LOC25483258 (mtr)LOC25496655 (mtr)LOC25496724 (mtr)LOC25496736 (mtr)LOC25496764 (mtr)LOC25497066 (mtr)LOC25497290 (mtr)LOC25497361 (mtr)AT1G12615 (ath)LOC100777512 (gma)LOC100777919 (gma)LOC100778062 (gma)LOC100778420 (gma)LOC100781818 (gma)LOC100782898 (gma)LOC100786237 (gma)LOC100786599 (gma)LOC100789435 (gma)LOC100793769 (gma)LOC100794739 (gma)LOC100796249 (gma)LOC100807278 (gma)LOC100808007 (gma)LOC100811076 (gma)LOC100811865 (gma)LOC100812093 (gma)LOC100812458 (gma)LOC100812993 (gma)LOC100813712 (gma)LOC100814966 (gma)LOC100818504 (gma)LOC100818857 (gma)LOC100819931 (gma)LOC100820602 (gma)LOC101244875 (sly)LOC101248205 (sly)LOC101256290 (sly)LOC101263217 (sly)LOC101266330 (sly)LOC102663208 (gma)LOC102663951 (gma)LOC102668851 (gma)LOC102669963 (gma)LOC103833524 (bra)LOC103836144 (bra)LOC103836146 (bra)LOC103836151 (bra)LOC103838039 (bra)LOC103838041 (bra)LOC103838174 (bra)LOC103838255 (bra)LOC103838258 (bra)LOC103838282 (bra)LOC103838333 (bra)LOC103838376 (bra)LOC103838525 (bra)LOC103839829 (bra)LOC103843088 (bra)LOC103843103 (bra)LOC103843107 (bra)LOC103843127 (bra)LOC103843546 (bra)LOC103846313 (bra)LOC103864061 (bra)LOC103866658 (bra)LOC103871206 (bra)LOC106794624 (gma)LOC106796589 (gma)LOC106799227 (gma)LOC112327322 (ppo)LOC112327523 (ppo)LOC112327640 (ppo)LOC112417994 (mtr)LOC112997677 (gma)LOC112999808 (gma)LOC120575769 (mtr)LOC120576066 (mtr)LOC120576067 (mtr)LOC120576109 (mtr)LOC120576111 (mtr)LOC120576112 (mtr)LOC120576114 (mtr)LOC120576116 (mtr)LOC120576117 (mtr)LOC120580925 (mtr)LOC121173775 (gma)
Subcellular
localization
wolf
chlo 8,  chlo_mito 5,  mito 1  (predict for NP_001322835.1)
chlo 8,  chlo_mito 5,  mito 1  (predict for NP_176447.1)
Subcellular
localization
TargetP
mito 5,  chlo 3  (predict for NP_001322835.1)
mito 5,  chlo 3  (predict for NP_176447.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with AT1G62590 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
18.3 AT1G63330 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein [detail] 842639
9.9 AT1G63400 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein [detail] 842646
9.5 AT1G62910 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein [detail] 842592
7.4 AT1G12775 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein [detail] 3766712
5.3 AT1G63230 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [detail] 842628
4.2 AT2G42510 survival motor neuron interacting protein [detail] 818851
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for AT1G62590]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 842556    
Refseq ID (protein) NP_001322835.1 
NP_176447.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].