[][] ath   AT5G41170 Gene
functional annotation
Function   Pentatricopeptide repeat (PPR-like) superfamily protein
GO BP
GO CC
GO:0005739 [list] [network] mitochondrion  (4405 genes)  IEA ISM  
GO:0009507 [list] [network] chloroplast  (5095 genes)  ISM  
GO MF
KEGG
Protein NP_001330211.1  NP_001330212.1  NP_198933.1 
BLAST NP_001330211.1  NP_001330212.1  NP_198933.1 
Orthologous [Ortholog page] AT3G16710 (ath)AT3G22470 (ath)AT4G26800 (ath)AT5G16640 (ath)AT1G06580 (ath)AT1G12300 (ath)AT1G12620 (ath)RPF1 (ath)AT1G62590 (ath)RPF2 (ath)AT1G62680 (ath)NG1 (ath)AT1G62910 (ath)RPF3 (ath)AT1G63070 (ath)AT1G63080 (ath)AT1G63130 (ath)AT1G63150 (ath)AT1G63330 (ath)AT1G63400 (ath)AT1G64580 (ath)AT1G12775 (ath)LOC7455414 (ppo)LOC7465949 (ppo)LOC7497413 (ppo)AT1G62914 (ath)AT1G64583 (ath)LOC11409172 (mtr)LOC11411617 (mtr)LOC11411874 (mtr)LOC11413784 (mtr)LOC11414076 (mtr)LOC11416151 (mtr)LOC11417300 (mtr)LOC11419137 (mtr)LOC11419300 (mtr)LOC11419320 (mtr)LOC11420208 (mtr)LOC11422222 (mtr)LOC11430397 (mtr)LOC11436467 (mtr)LOC11439118 (mtr)LOC25479607 (mtr)LOC25479611 (mtr)LOC25479678 (mtr)LOC25480002 (mtr)LOC25480323 (mtr)LOC25480558 (mtr)LOC25480855 (mtr)LOC25481060 (mtr)LOC25481299 (mtr)LOC25481803 (mtr)LOC25482431 (mtr)LOC25483258 (mtr)LOC25496585 (mtr)LOC25496655 (mtr)LOC25496724 (mtr)LOC25496733 (mtr)LOC25496736 (mtr)LOC25496740 (mtr)LOC25496751 (mtr)LOC25496764 (mtr)LOC25496765 (mtr)LOC25497066 (mtr)LOC25497290 (mtr)LOC25497361 (mtr)LOC100243276 (vvi)LOC100244236 (vvi)LOC100246659 (vvi)LOC100252034 (vvi)LOC100253509 (vvi)LOC100255400 (vvi)LOC100256928 (vvi)LOC100258882 (vvi)LOC100265584 (vvi)LOC100777512 (gma)LOC100777919 (gma)LOC100778062 (gma)LOC100778420 (gma)LOC100781818 (gma)LOC100789435 (gma)LOC100793769 (gma)LOC100795807 (gma)LOC100796249 (gma)LOC100807278 (gma)LOC100811076 (gma)LOC100811865 (gma)LOC100812093 (gma)LOC100813712 (gma)LOC100818504 (gma)LOC100852554 (vvi)LOC101244875 (sly)LOC101248205 (sly)LOC101256290 (sly)LOC101263217 (sly)LOC101266330 (sly)LOC102663208 (gma)LOC102669831 (gma)LOC103833524 (bra)LOC103836144 (bra)LOC103836146 (bra)LOC103836151 (bra)LOC103838039 (bra)LOC103838041 (bra)LOC103838174 (bra)LOC103838255 (bra)LOC103838258 (bra)LOC103838282 (bra)LOC103838376 (bra)LOC103839829 (bra)LOC103843088 (bra)LOC103843103 (bra)LOC103843107 (bra)LOC103843127 (bra)LOC103843546 (bra)LOC103846313 (bra)LOC103864061 (bra)LOC103866658 (bra)LOC103871206 (bra)LOC104879278 (vvi)LOC106796589 (gma)LOC112417994 (mtr)LOC112422668 (mtr)LOC112999808 (gma)
Subcellular
localization
wolf
cyto 7,  nucl 1,  cysk 1,  golg 1,  nucl_plas 1  (predict for NP_001330211.1)
chlo 6,  mito 3,  cyto_mito 2  (predict for NP_001330212.1)
chlo 6,  chlo_mito 5,  mito 3,  cyto_mito 1  (predict for NP_198933.1)
Subcellular
localization
TargetP
scret 7,  other 3  (predict for NP_001330211.1)
mito 8  (predict for NP_001330212.1)
mito 8  (predict for NP_198933.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for AT5G41170]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
249341_at
249341_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
249341_at
249341_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.

AtGenExpress*
(Hormone)
249341_at
249341_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.

Link to other DBs
Entrez Gene ID 834119    
Refseq ID (protein) NP_001330211.1 
NP_001330212.1 
NP_198933.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].