[←][→] ath   At5g16640 Gene
functional annotation
Function   Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein  
GO BP
GO CC
GO:0005739 [list] [network] mitochondrion  (4228 genes)  ISM  
GO MF
KEGG
Protein NP_197167.1 
BLAST NP_197167.1 
Orthologous [Ortholog page] AT3G16710 (ath)  AT3G22470 (ath)  AT4G26800 (ath)  AT5G41170 (ath)  AT1G06580 (ath)  AT1G12300 (ath)  AT1G12620 (ath)  RPF1 (ath)  AT1G62590 (ath)  RPF2 (ath)  AT1G62680 (ath)  NG1 (ath)  AT1G62910 (ath)  RPF3 (ath)  AT1G63070 (ath)  AT1G63080 (ath)  AT1G63130 (ath)  AT1G63150 (ath)  AT1G63400 (ath)  AT1G64580 (ath)  AT1G12775 (ath)  LOC7455414 (ppo)  LOC7459907 (ppo)  LOC7465949 (ppo)  LOC7473913 (ppo)  LOC7494521 (ppo)  LOC7497413 (ppo)  AT1G62914 (ath)  AT1G64583 (ath)  LOC11409172 (mtr)  LOC11411874 (mtr)  LOC11413784 (mtr)  LOC11414076 (mtr)  LOC11416151 (mtr)  LOC11417289 (mtr)  LOC11418245 (mtr)  LOC11419137 (mtr)  LOC11419320 (mtr)  LOC11420208 (mtr)  LOC11422222 (mtr)  LOC11422820 (mtr)  LOC11430397 (mtr)  LOC11436467 (mtr)  LOC11439118 (mtr)  LOC18097550 (ppo)  LOC18098827 (ppo)  LOC18098888 (ppo)  LOC18098897 (ppo)  LOC18098899 (ppo)  LOC18098911 (ppo)  LOC18098937 (ppo)  LOC18098938 (ppo)  LOC18098941 (ppo)  LOC18099092 (ppo)  LOC18100671 (ppo)  LOC18100718 (ppo)  LOC18104626 (ppo)  LOC18104675 (ppo)  LOC18106079 (ppo)  LOC18106937 (ppo)  LOC18107488 (ppo)  LOC18109035 (ppo)  LOC18110965 (ppo)  LOC18110967 (ppo)  LOC25479607 (mtr)  LOC25479611 (mtr)  LOC25479678 (mtr)  LOC25480002 (mtr)  LOC25480032 (mtr)  LOC25480855 (mtr)  LOC25481060 (mtr)  LOC25481299 (mtr)  LOC25481305 (mtr)  LOC25482431 (mtr)  LOC25483258 (mtr)  LOC25496655 (mtr)  LOC25496724 (mtr)  LOC25496736 (mtr)  LOC25496764 (mtr)  LOC25497066 (mtr)  LOC25497290 (mtr)  LOC25497361 (mtr)  AT1G12615 (ath)  LOC100777512 (gma)  LOC100777919 (gma)  LOC100778062 (gma)  LOC100778420 (gma)  LOC100781818 (gma)  LOC100782898 (gma)  LOC100786237 (gma)  LOC100786599 (gma)  LOC100789435 (gma)  LOC100793769 (gma)  LOC100794739 (gma)  LOC100796249 (gma)  LOC100807278 (gma)  LOC100808007 (gma)  LOC100811076 (gma)  LOC100811865 (gma)  LOC100812093 (gma)  LOC100812458 (gma)  LOC100812993 (gma)  LOC100813712 (gma)  LOC100814966 (gma)  LOC100818504 (gma)  LOC100818857 (gma)  LOC100819931 (gma)  LOC100820602 (gma)  LOC101244875 (sly)  LOC101248205 (sly)  LOC101256290 (sly)  LOC101263217 (sly)  LOC101266330 (sly)  LOC102663208 (gma)  LOC102663951 (gma)  LOC102668851 (gma)  LOC102669963 (gma)  LOC103833524 (bra)  LOC103836144 (bra)  LOC103836146 (bra)  LOC103836151 (bra)  LOC103838039 (bra)  LOC103838041 (bra)  LOC103838174 (bra)  LOC103838255 (bra)  LOC103838258 (bra)  LOC103838282 (bra)  LOC103838333 (bra)  LOC103838376 (bra)  LOC103838525 (bra)  LOC103839829 (bra)  LOC103843088 (bra)  LOC103843103 (bra)  LOC103843107 (bra)  LOC103843127 (bra)  LOC103843546 (bra)  LOC103846313 (bra)  LOC103864061 (bra)  LOC103866658 (bra)  LOC103871206 (bra)  LOC106794624 (gma)  LOC106796589 (gma)  LOC106799227 (gma)  LOC112327322 (ppo)  LOC112327523 (ppo)  LOC112327640 (ppo)  LOC112417994 (mtr)  LOC112997677 (gma)  LOC112999808 (gma)  LOC120575769 (mtr)  LOC120576066 (mtr)  LOC120576067 (mtr)  LOC120576109 (mtr)  LOC120576111 (mtr)  LOC120576112 (mtr)  LOC120576114 (mtr)  LOC120576116 (mtr)  LOC120576117 (mtr)  LOC120580925 (mtr)  LOC121173775 (gma) 
Subcellular
localization
wolf
mito 5,  cyto_mito 3,  chlo 2,  nucl 2  (predict for NP_197167.1)
Subcellular
localization
TargetP
mito 6,  chlo 3  (predict for NP_197167.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with AT5G16640 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
7.3 AT1G06580 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein [detail] 837169
7.2 AT1G12620 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein [detail] 837818
6.7 RPF2 rna processing factor 2 [detail] 842564
6.6 AT4G10800 BTB/POZ domain protein [detail] 826676
Coexpressed
gene list		 [Coexpressed gene list for AT5G16640]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
AtGenExpress*
(Development)
250106_at
250106_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
"1st Q", "mean" and "3rd Q" indecate the values for all genes on a GeneChip. Q: quartile.

AtGenExpress*
(Stress)
250106_at
250106_at.png

X axis is samples (pdf file), and Y axis is log2-expression.
AtGenExpress*
(Hormone)
250106_at
250106_at.png

X axis is samples (xls file), and Y axis is log-expression.
Link to other DBs
Entrez Gene ID 831526      
Refseq ID (protein) NP_197167.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].