[←][→] ath   At5g58500 Gene
functional annotation
Function   LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS-like protein (DUF640)      
GO BP
GO:0009299 [list] [network] mRNA transcription  (13 genes)  ISS  
GO:0090698 [list] [network] post-embryonic plant morphogenesis  (221 genes)  ISS  
GO CC
GO:0005634 [list] [network] nucleus  (10305 genes)  ISS  
GO MF
KEGG
Protein NP_001318830.1 
BLAST NP_001318830.1 
Orthologous [Ortholog page] LSH3 (ath)  LSH10 (ath)  LSH2 (ath)  LSH4 (ath)  LSH1 (ath)  LSH6 (ath)  LSH8 (ath)  LSH7 (ath)  LOC4328416 (osa)  LOC4330024 (osa)  LOC4331099 (osa)  LOC4336401 (osa)  LOC4338491 (osa)  LOC4341811 (osa)  LOC7454352 (ppo)  LOC7455905 (ppo)  LOC7455945 (ppo)  LOC7458006 (ppo)  LOC7458242 (ppo)  LOC7460096 (ppo)  LOC7467540 (ppo)  LOC7470206 (ppo)  LOC7471962 (ppo)  LOC7474992 (ppo)  LOC7480386 (ppo)  LOC7487181 (ppo)  LOC7487704 (ppo)  LOC7489106 (ppo)  LOC7496798 (ppo)  LOC9266624 (osa)  LOC11407427 (mtr)  LOC11408401 (mtr)  LOC11408456 (mtr)  LOC11409774 (mtr)  LOC11410018 (mtr)  LOC11410358 (mtr)  LOC11419093 (mtr)  LOC11434608 (mtr)  LOC18095487 (ppo)  LOC18102467 (ppo)  LOC25484251 (mtr)  LOC25485780 (mtr)  LOC25485963 (mtr)  LOC25493337 (mtr)  LOC25499270 (mtr)  LOC25499718 (mtr)  LSH9 (ath)  LOC100306082 (gma)  LOC100306225 (gma)  LOC100527164 (gma)  LOC100527409 (gma)  LOC100527554 (gma)  LOC100775798 (gma)  LOC100775838 (gma)  LOC100778283 (gma)  LOC100778886 (gma)  LOC100780494 (gma)  LOC100786135 (gma)  LOC100789834 (gma)  LOC100791424 (gma)  LOC100802715 (gma)  LOC100802937 (gma)  LOC100803605 (gma)  LOC100803965 (gma)  LOC100806134 (gma)  LOC100806493 (gma)  LOC100806497 (gma)  LOC100810350 (gma)  LOC100810655 (gma)  LOC100815968 (gma)  TFAM1 (sly)  LOC101244207 (sly)  LOC101246185 (sly)  LOC101247206 (sly)  TFAM2 (sly)  LOC101252299 (sly)  LOC101253723 (sly)  LOC101256738 (sly)  LOC101260873 (sly)  LOC101261831 (sly)  LOC101262247 (sly)  LOC101263979 (sly)  LOC102663941 (gma)  LOC103828755 (bra)  LOC103832357 (bra)  LOC103837296 (bra)  LOC103843480 (bra)  LOC103843985 (bra)  LOC103845278 (bra)  LOC103845279 (bra)  LOC103848911 (bra)  LOC103850046 (bra)  LOC103851635 (bra)  LOC103853147 (bra)  LOC103853659 (bra)  LOC103854635 (bra)  LOC103858024 (bra)  LOC103859037 (bra)  LOC103861005 (bra)  LOC103865110 (bra)  LOC103865960 (bra)  LOC103866652 (bra)  LOC103867894 (bra)  LOC103867981 (bra)  LOC103874577 (bra)  LOC107276238 (osa)  LOC107278201 (osa)  LOC107278610 (osa)  LOC117125638 (bra)  LOC123041251 (tae)  LOC123045668 (tae)  LOC123046119 (tae)  LOC123049257 (tae)  LOC123052627 (tae)  LOC123053999 (tae)  LOC123058740 (tae)  LOC123074939 (tae)  LOC123127737 (tae)  LOC123128934 (tae)  LOC123136756 (tae)  LOC123137510 (tae)  LOC123144860 (tae)  LOC123146052 (tae)  LOC123149104 (tae)  LOC123159994 (tae)  LOC123166451 (tae)  LOC123181080 (tae)  LOC123181711 (tae)  LOC123185303 (tae)  LOC123189888 (tae)  LOC123402509 (hvu)  LOC123403258 (hvu)  LOC123409615 (hvu)  LOC123411667 (hvu)  LOC123412451 (hvu)  LOC123427243 (hvu)  LOC123430078 (hvu)  LOC123440575 (hvu)  LOC123444893 (hvu) 
Subcellular
localization
wolf
mito 6,  nucl 4  (predict for NP_001318830.1)
Subcellular
localization
TargetP
chlo 6  (predict for NP_001318830.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with LSH5 on the network
coex z* Locus Function* CoexViewer Entrez Gene ID*
5.1 GDU1 glutamine dumper 1 [detail] 829301
4.2 LSH3 LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS-like protein (DUF640) [detail] 817672
4.1 SP1L5 SPIRAL1-like5 [detail] 828449
Coexpressed
gene list		 [Coexpressed gene list for LSH5]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 28721277      
Refseq ID (protein) NP_001318830.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].