[][] gma   GLYMA_10G181200 Gene
functional annotation
Function   protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 4
GO BP
GO CC
GO MF
KEGG
Protein XP_003536217.1  XP_006589267.1 
BLAST XP_003536217.1  XP_006589267.1 
Orthologous [Ortholog page] LSH3 (ath)LSH10 (ath)LSH2 (ath)LSH4 (ath)LSH1 (ath)LSH6 (ath)LSH8 (ath)LSH7 (ath)LOC4330024 (osa)LOC4331099 (osa)LOC4336401 (osa)LOC4338491 (osa)LOC7454352 (ppo)LOC7455945 (ppo)LOC7467540 (ppo)LOC7471962 (ppo)LOC7474992 (ppo)LOC7487181 (ppo)LOC7487704 (ppo)LOC7489106 (ppo)LOC9266624 (osa)LOC11407427 (mtr)LOC11408401 (mtr)LOC11408456 (mtr)LOC11409774 (mtr)LOC11410018 (mtr)LOC11410358 (mtr)LOC11419093 (mtr)LOC11434608 (mtr)LOC25484251 (mtr)LOC25485780 (mtr)LOC25485963 (mtr)LOC25499270 (mtr)LOC25499718 (mtr)LSH5 (ath)LOC100192901 (zma)LOC100217086 (zma)LOC100244642 (vvi)LOC100249172 (vvi)LOC100254926 (vvi)LOC100257253 (vvi)LOC100260366 (vvi)LOC100265705 (vvi)LOC100266079 (vvi)LOC100274783 (zma)LOC100275232 (zma)LOC100276429 (zma)LOC100278049 (zma)LOC100278742 (zma)LOC100304411 (zma)LOC100306082 (gma)LOC100306225 (gma)LOC100527164 (gma)LOC100527409 (gma)LOC100527554 (gma)LOC100778283 (gma)LOC100778886 (gma)LOC100780494 (gma)LOC100786135 (gma)LOC100791424 (gma)LOC100802715 (gma)LOC100802937 (gma)LOC100803605 (gma)LOC100803965 (gma)LOC100806134 (gma)LOC100806493 (gma)LOC100806497 (gma)LOC100810655 (gma)LOC100815968 (gma)TFAM1 (sly)LOC101246185 (sly)LOC101247206 (sly)TFAM2 (sly)LOC101252299 (sly)LOC101253723 (sly)LOC101256738 (sly)LOC101260873 (sly)LOC101261831 (sly)LOC101262247 (sly)LOC101263979 (sly)LOC102663941 (gma)LOC103636537 (zma)LOC103651051 (zma)LOC103828755 (bra)LOC103832357 (bra)LOC103833736 (bra)LOC103837296 (bra)LOC103843480 (bra)LOC103843985 (bra)LOC103845277 (bra)LOC103848911 (bra)LOC103851635 (bra)LOC103853147 (bra)LOC103854635 (bra)LOC103858024 (bra)LOC103859037 (bra)LOC103865110 (bra)LOC103865960 (bra)LOC103866652 (bra)LOC103867894 (bra)LOC103867981 (bra)LOC103874577 (bra)LOC104879291 (vvi)LOC107276238 (osa)LOC107278610 (osa)
Subcellular
localization
wolf
nucl 9  (predict for XP_003536217.1)
nucl 9  (predict for XP_006589267.1)
Subcellular
localization
TargetP
chlo 9  (predict for XP_003536217.1)
chlo 9  (predict for XP_006589267.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
gma04075 Plant hormone signal transduction 2
Genes directly connected with LOC100789834 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail
Entrez Gene ID*
6.3 LOC100527164 uncharacterized LOC100527164 [detail] 100527164
6.0 LOC100778283 protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 4 [detail] 100778283
5.8 LOC102660463 homeobox protein knotted-1-like 1 [detail] 102660463
5.2 LOC100806497 protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 4 [detail] 100806497
5.1 LOC100784522 trihelix transcription factor PTL [detail] 100784522
4.6 LOC100810379 BEL1-like homeodomain protein 8 [detail] 100810379
4.3 LOC732585 WRKY transcription factor 40 [detail] 732585
4.0 LOC100803605 protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 4 [detail] 100803605
3.9 LOC102669874 uncharacterized LOC102669874 [detail] 102669874
3.8 LOC102668664 uncharacterized LOC102668664 [detail] 102668664
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for LOC100789834]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 100789834    
Refseq ID (protein) XP_003536217.1 
XP_006589267.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].