[][] ppo   POPTR_013G046500v3 Gene
functional annotation
Function   protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 1
GO BP
GO CC
GO MF
KEGG
Protein XP_024438972.1 
BLAST XP_024438972.1 
Orthologous [Ortholog page] LSH3 (ath)LSH10 (ath)LSH2 (ath)LSH4 (ath)LSH1 (ath)LSH6 (ath)LSH8 (ath)LSH7 (ath)LOC4330024 (osa)LOC4331099 (osa)LOC4336401 (osa)LOC4338491 (osa)LOC7454352 (ppo)LOC7455945 (ppo)LOC7467540 (ppo)LOC7471962 (ppo)LOC7474992 (ppo)LOC7487181 (ppo)LOC7489106 (ppo)LOC9266624 (osa)LOC11407427 (mtr)LOC11408401 (mtr)LOC11408456 (mtr)LOC11409774 (mtr)LOC11410018 (mtr)LOC11410358 (mtr)LOC11419093 (mtr)LOC11434608 (mtr)LOC25484251 (mtr)LOC25485780 (mtr)LOC25485963 (mtr)LOC25499270 (mtr)LOC25499718 (mtr)LSH5 (ath)LOC100192901 (zma)LOC100217086 (zma)LOC100244642 (vvi)LOC100249172 (vvi)LOC100254926 (vvi)LOC100257253 (vvi)LOC100260366 (vvi)LOC100265705 (vvi)LOC100266079 (vvi)LOC100274783 (zma)LOC100275232 (zma)LOC100276429 (zma)LOC100278049 (zma)LOC100278742 (zma)LOC100304411 (zma)LOC100306082 (gma)LOC100306225 (gma)LOC100527164 (gma)LOC100527409 (gma)LOC100527554 (gma)LOC100778283 (gma)LOC100778886 (gma)LOC100780494 (gma)LOC100786135 (gma)LOC100789834 (gma)LOC100791424 (gma)LOC100802715 (gma)LOC100802937 (gma)LOC100803605 (gma)LOC100803965 (gma)LOC100806134 (gma)LOC100806493 (gma)LOC100806497 (gma)LOC100810655 (gma)LOC100815968 (gma)TFAM1 (sly)LOC101246185 (sly)LOC101247206 (sly)TFAM2 (sly)LOC101252299 (sly)LOC101253723 (sly)LOC101256738 (sly)LOC101260873 (sly)LOC101261831 (sly)LOC101262247 (sly)LOC101263979 (sly)LOC102663941 (gma)LOC103636537 (zma)LOC103651051 (zma)LOC103828755 (bra)LOC103832357 (bra)LOC103833736 (bra)LOC103837296 (bra)LOC103843480 (bra)LOC103843985 (bra)LOC103845277 (bra)LOC103848911 (bra)LOC103851635 (bra)LOC103853147 (bra)LOC103854635 (bra)LOC103858024 (bra)LOC103859037 (bra)LOC103865110 (bra)LOC103865960 (bra)LOC103866652 (bra)LOC103867894 (bra)LOC103867981 (bra)LOC103874577 (bra)LOC104879291 (vvi)LOC107276238 (osa)LOC107278610 (osa)
Subcellular
localization
wolf
chlo 6,  nucl 4  (predict for XP_024438972.1)
Subcellular
localization
TargetP
chlo 9,  other 3  (predict for XP_024438972.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with LOC7487704 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail
Entrez Gene ID*
7.4 LOC7467540 protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 4 [detail] 7467540
6.8 LOC7487181 protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 1 [detail] 7487181
5.8 LOC7454352 protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 4 [detail] 7454352
5.6 LOC7471962 protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 3 [detail] 7471962
5.1 LOC7467239 homeobox protein knotted-1-like 2 [detail] 7467239
4.5 LOC7492749 uncharacterized protein At5g41620 [detail] 7492749
4.0 LOC7472754 uncharacterized LOC7472754 [detail] 7472754
3.8 LOC7486577 homeobox-leucine zipper protein ATHB-6 [detail] 7486577
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for LOC7487704]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 7487704    
Refseq ID (protein) XP_024438972.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].