[←][→] vvi   VIT_00021215001 Gene
functional annotation
Function   protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 10  
GO BP
GO CC
GO MF
KEGG
Protein XP_010655519.1  XP_010655520.1 
BLAST XP_010655519.1  XP_010655520.1 
Orthologous [Ortholog page] LSH3 (ath)  LSH10 (ath)  LSH2 (ath)  LSH4 (ath)  LSH1 (ath)  LSH6 (ath)  LSH8 (ath)  LSH7 (ath)  LOC4330024 (osa)  LOC4331099 (osa)  LOC4336401 (osa)  LOC4338491 (osa)  LOC7454352 (ppo)  LOC7455945 (ppo)  LOC7467540 (ppo)  LOC7471962 (ppo)  LOC7474992 (ppo)  LOC7487181 (ppo)  LOC7487704 (ppo)  LOC7489106 (ppo)  LOC9266624 (osa)  LOC11407427 (mtr)  LOC11408401 (mtr)  LOC11408456 (mtr)  LOC11409774 (mtr)  LOC11410018 (mtr)  LOC11410358 (mtr)  LOC11419093 (mtr)  LOC11434608 (mtr)  LOC25484251 (mtr)  LOC25485780 (mtr)  LOC25485963 (mtr)  LOC25499270 (mtr)  LOC25499718 (mtr)  LSH5 (ath)  LOC100192901 (zma)  LOC100217086 (zma)  LOC100244642 (vvi)  LOC100249172 (vvi)  LOC100257253 (vvi)  LOC100260366 (vvi)  LOC100265705 (vvi)  LOC100266079 (vvi)  LOC100274783 (zma)  LOC100275232 (zma)  LOC100276429 (zma)  LOC100278049 (zma)  LOC100278742 (zma)  LOC100304411 (zma)  LOC100306082 (gma)  LOC100306225 (gma)  LOC100527164 (gma)  LOC100527409 (gma)  LOC100527554 (gma)  LOC100778283 (gma)  LOC100778886 (gma)  LOC100780494 (gma)  LOC100786135 (gma)  LOC100789834 (gma)  LOC100791424 (gma)  LOC100802715 (gma)  LOC100802937 (gma)  LOC100803605 (gma)  LOC100803965 (gma)  LOC100806134 (gma)  LOC100806493 (gma)  LOC100806497 (gma)  LOC100810655 (gma)  LOC100815968 (gma)  TFAM1 (sly)  LOC101246185 (sly)  LOC101247206 (sly)  TFAM2 (sly)  LOC101252299 (sly)  LOC101253723 (sly)  LOC101256738 (sly)  LOC101260873 (sly)  LOC101261831 (sly)  LOC101262247 (sly)  LOC101263979 (sly)  LOC102663941 (gma)  LOC103636537 (zma)  LOC103651051 (zma)  LOC103828755 (bra)  LOC103832357 (bra)  LOC103833736 (bra)  LOC103837296 (bra)  LOC103843480 (bra)  LOC103843985 (bra)  LOC103845277 (bra)  LOC103848911 (bra)  LOC103851635 (bra)  LOC103853147 (bra)  LOC103854635 (bra)  LOC103858024 (bra)  LOC103859037 (bra)  LOC103865110 (bra)  LOC103865960 (bra)  LOC103866652 (bra)  LOC103867894 (bra)  LOC103867981 (bra)  LOC103874577 (bra)  LOC104879291 (vvi)  LOC107276238 (osa)  LOC107278610 (osa) 
Subcellular
localization
wolf
nucl 9,  chlo 1,  cyto 1  (predict for XP_010655519.1)
nucl 9,  chlo 1,  cyto 1  (predict for XP_010655520.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 7  (predict for XP_010655519.1)
other 7  (predict for XP_010655520.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with LOC100254926 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail		 Entrez Gene ID*
6.7 LOC100257253 protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 10-like [detail] 100257253
5.3 LOC100266079 protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 10 [detail] 100266079
5.2 LOC100259040 homeobox-leucine zipper protein HAT22 [detail] 100259040
4.6 LOC100265705 protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 6 [detail] 100265705
3.6 LOC100254670 probable WRKY transcription factor 12 [detail] 100254670
Coexpressed
gene list		 [Coexpressed gene list for LOC100254926]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 100254926      
Refseq ID (protein) XP_010655519.1 
XP_010655520.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].