[←][→] ppo   POPTR_005G225600v3 Gene
functional annotation
Function   protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 4  
GO BP
GO CC
GO MF
KEGG
Protein XP_002306857.2 
BLAST XP_002306857.2 
Orthologous [Ortholog page] LSH3 (ath)  LSH10 (ath)  LSH2 (ath)  LSH4 (ath)  LSH1 (ath)  LSH6 (ath)  LSH8 (ath)  LSH7 (ath)  LOC4330024 (osa)  LOC4331099 (osa)  LOC4336401 (osa)  LOC4338491 (osa)  LOC7455945 (ppo)  LOC7467540 (ppo)  LOC7471962 (ppo)  LOC7474992 (ppo)  LOC7487181 (ppo)  LOC7487704 (ppo)  LOC7489106 (ppo)  LOC9266624 (osa)  LOC11407427 (mtr)  LOC11408401 (mtr)  LOC11408456 (mtr)  LOC11409774 (mtr)  LOC11410018 (mtr)  LOC11410358 (mtr)  LOC11419093 (mtr)  LOC11434608 (mtr)  LOC25484251 (mtr)  LOC25485780 (mtr)  LOC25485963 (mtr)  LOC25499270 (mtr)  LOC25499718 (mtr)  LSH5 (ath)  LOC100192901 (zma)  LOC100217086 (zma)  LOC100244642 (vvi)  LOC100249172 (vvi)  LOC100254926 (vvi)  LOC100257253 (vvi)  LOC100260366 (vvi)  LOC100265705 (vvi)  LOC100266079 (vvi)  LOC100274783 (zma)  LOC100275232 (zma)  LOC100276429 (zma)  LOC100278049 (zma)  LOC100278742 (zma)  LOC100304411 (zma)  LOC100306082 (gma)  LOC100306225 (gma)  LOC100527164 (gma)  LOC100527409 (gma)  LOC100527554 (gma)  LOC100778283 (gma)  LOC100778886 (gma)  LOC100780494 (gma)  LOC100786135 (gma)  LOC100789834 (gma)  LOC100791424 (gma)  LOC100802715 (gma)  LOC100802937 (gma)  LOC100803605 (gma)  LOC100803965 (gma)  LOC100806134 (gma)  LOC100806493 (gma)  LOC100806497 (gma)  LOC100810655 (gma)  LOC100815968 (gma)  TFAM1 (sly)  LOC101246185 (sly)  LOC101247206 (sly)  TFAM2 (sly)  LOC101252299 (sly)  LOC101253723 (sly)  LOC101256738 (sly)  LOC101260873 (sly)  LOC101261831 (sly)  LOC101262247 (sly)  LOC101263979 (sly)  LOC102663941 (gma)  LOC103636537 (zma)  LOC103651051 (zma)  LOC103828755 (bra)  LOC103832357 (bra)  LOC103833736 (bra)  LOC103837296 (bra)  LOC103843480 (bra)  LOC103843985 (bra)  LOC103845277 (bra)  LOC103848911 (bra)  LOC103851635 (bra)  LOC103853147 (bra)  LOC103854635 (bra)  LOC103858024 (bra)  LOC103859037 (bra)  LOC103865110 (bra)  LOC103865960 (bra)  LOC103866652 (bra)  LOC103867894 (bra)  LOC103867981 (bra)  LOC103874577 (bra)  LOC104879291 (vvi)  LOC107276238 (osa)  LOC107278610 (osa) 
Subcellular
localization
wolf
nucl 10  (predict for XP_002306857.2)
Subcellular
localization
TargetP
chlo 9,  other 3  (predict for XP_002306857.2)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with LOC7454352 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail		 Entrez Gene ID*
7.8 LOC7471962 protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 3 [detail] 7471962
5.8 LOC7487704 protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 1 [detail] 7487704
5.6 LOC7467540 protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 4 [detail] 7467540
4.9 LOC7474992 protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 5 [detail] 7474992
4.4 LOC7478899 homeobox protein knotted-1-like 1 [detail] 7478899
3.7 LOC7479311 transcription factor GLABRA 3 [detail] 7479311
3.5 LOC7489106 protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 4 [detail] 7489106
Coexpressed
gene list		 [Coexpressed gene list for LOC7454352]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 7454352      
Refseq ID (protein) XP_002306857.2 


The preparation time of this page was 0.2 [sec].