[][] vvi   100257253 Gene
functional annotation
Function   protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 10-like
GO BP
GO CC
GO MF
KEGG
Protein XP_002285447.1 
BLAST XP_002285447.1 
Orthologous [Ortholog page] LSH3 (ath)LSH10 (ath)LSH2 (ath)LSH4 (ath)LSH1 (ath)LSH6 (ath)LSH8 (ath)LSH7 (ath)LOC4330024 (osa)LOC4331099 (osa)LOC4336401 (osa)LOC4338491 (osa)LOC7454352 (ppo)LOC7455945 (ppo)LOC7467540 (ppo)LOC7471962 (ppo)LOC7474992 (ppo)LOC7487181 (ppo)LOC7487704 (ppo)LOC7489106 (ppo)LOC9266624 (osa)LOC11407427 (mtr)LOC11408401 (mtr)LOC11408456 (mtr)LOC11409774 (mtr)LOC11410018 (mtr)LOC11410358 (mtr)LOC11419093 (mtr)LOC11434608 (mtr)LOC25484251 (mtr)LOC25485780 (mtr)LOC25485963 (mtr)LOC25499270 (mtr)LOC25499718 (mtr)LSH5 (ath)LOC100192901 (zma)LOC100217086 (zma)LOC100244642 (vvi)LOC100249172 (vvi)LOC100254926 (vvi)LOC100260366 (vvi)LOC100265705 (vvi)LOC100266079 (vvi)LOC100274783 (zma)LOC100275232 (zma)LOC100276429 (zma)LOC100278049 (zma)LOC100278742 (zma)LOC100304411 (zma)LOC100306082 (gma)LOC100306225 (gma)LOC100527164 (gma)LOC100527409 (gma)LOC100527554 (gma)LOC100778283 (gma)LOC100778886 (gma)LOC100780494 (gma)LOC100786135 (gma)LOC100789834 (gma)LOC100791424 (gma)LOC100802715 (gma)LOC100802937 (gma)LOC100803605 (gma)LOC100803965 (gma)LOC100806134 (gma)LOC100806493 (gma)LOC100806497 (gma)LOC100810655 (gma)LOC100815968 (gma)TFAM1 (sly)LOC101246185 (sly)LOC101247206 (sly)TFAM2 (sly)LOC101252299 (sly)LOC101253723 (sly)LOC101256738 (sly)LOC101260873 (sly)LOC101261831 (sly)LOC101262247 (sly)LOC101263979 (sly)LOC102663941 (gma)LOC103636537 (zma)LOC103651051 (zma)LOC103828755 (bra)LOC103832357 (bra)LOC103833736 (bra)LOC103837296 (bra)LOC103843480 (bra)LOC103843985 (bra)LOC103845277 (bra)LOC103848911 (bra)LOC103851635 (bra)LOC103853147 (bra)LOC103854635 (bra)LOC103858024 (bra)LOC103859037 (bra)LOC103865110 (bra)LOC103865960 (bra)LOC103866652 (bra)LOC103867894 (bra)LOC103867981 (bra)LOC103874577 (bra)LOC104879291 (vvi)LOC107276238 (osa)LOC107278610 (osa)
Subcellular
localization
wolf
nucl 8,  cyto_nucl 5,  cyto 1  (predict for XP_002285447.1)
Subcellular
localization
TargetP
scret 7  (predict for XP_002285447.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with LOC100257253 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail
Entrez Gene ID*
6.7 LOC100254926 protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 10 [detail] 100254926
5.9 LOC100266079 protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 10 [detail] 100266079
4.5 LOC100265705 protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 6 [detail] 100265705
3.8 LOC100253245 crocetin glucosyltransferase, chloroplastic [detail] 100253245
3.5 LOC100245113 AT-hook motif nuclear-localized protein 25 [detail] 100245113
2.9 LOC100250779 ankyrin repeat-containing protein At2g01680 [detail] 100250779
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for LOC100257253]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 100257253    
Refseq ID (protein) XP_002285447.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].