[][] ppo   POPTR_019G018600v3 Gene
functional annotation
Function   protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 1
GO BP
GO CC
GO MF
KEGG
Protein XP_002325335.2 
BLAST XP_002325335.2 
Orthologous [Ortholog page] LSH3 (ath)LSH10 (ath)LSH2 (ath)LSH4 (ath)LSH1 (ath)LSH6 (ath)LSH8 (ath)LSH7 (ath)LOC4330024 (osa)LOC4331099 (osa)LOC4336401 (osa)LOC4338491 (osa)LOC7454352 (ppo)LOC7455945 (ppo)LOC7467540 (ppo)LOC7471962 (ppo)LOC7474992 (ppo)LOC7487704 (ppo)LOC7489106 (ppo)LOC9266624 (osa)LOC11407427 (mtr)LOC11408401 (mtr)LOC11408456 (mtr)LOC11409774 (mtr)LOC11410018 (mtr)LOC11410358 (mtr)LOC11419093 (mtr)LOC11434608 (mtr)LOC25484251 (mtr)LOC25485780 (mtr)LOC25485963 (mtr)LOC25499270 (mtr)LOC25499718 (mtr)LSH5 (ath)LOC100192901 (zma)LOC100217086 (zma)LOC100244642 (vvi)LOC100249172 (vvi)LOC100254926 (vvi)LOC100257253 (vvi)LOC100260366 (vvi)LOC100265705 (vvi)LOC100266079 (vvi)LOC100274783 (zma)LOC100275232 (zma)LOC100276429 (zma)LOC100278049 (zma)LOC100278742 (zma)LOC100304411 (zma)LOC100306082 (gma)LOC100306225 (gma)LOC100527164 (gma)LOC100527409 (gma)LOC100527554 (gma)LOC100778283 (gma)LOC100778886 (gma)LOC100780494 (gma)LOC100786135 (gma)LOC100789834 (gma)LOC100791424 (gma)LOC100802715 (gma)LOC100802937 (gma)LOC100803605 (gma)LOC100803965 (gma)LOC100806134 (gma)LOC100806493 (gma)LOC100806497 (gma)LOC100810655 (gma)LOC100815968 (gma)TFAM1 (sly)LOC101246185 (sly)LOC101247206 (sly)TFAM2 (sly)LOC101252299 (sly)LOC101253723 (sly)LOC101256738 (sly)LOC101260873 (sly)LOC101261831 (sly)LOC101262247 (sly)LOC101263979 (sly)LOC102663941 (gma)LOC103636537 (zma)LOC103651051 (zma)LOC103828755 (bra)LOC103832357 (bra)LOC103833736 (bra)LOC103837296 (bra)LOC103843480 (bra)LOC103843985 (bra)LOC103845277 (bra)LOC103848911 (bra)LOC103851635 (bra)LOC103853147 (bra)LOC103854635 (bra)LOC103858024 (bra)LOC103859037 (bra)LOC103865110 (bra)LOC103865960 (bra)LOC103866652 (bra)LOC103867894 (bra)LOC103867981 (bra)LOC103874577 (bra)LOC104879291 (vvi)LOC107276238 (osa)LOC107278610 (osa)
Subcellular
localization
wolf
chlo 9  (predict for XP_002325335.2)
Subcellular
localization
TargetP
chlo 9,  other 4  (predict for XP_002325335.2)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with LOC7487181 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail
Entrez Gene ID*
6.8 LOC7487704 protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 1 [detail] 7487704
6.5 LOC7467239 homeobox protein knotted-1-like 2 [detail] 7467239
6.4 LOC7467540 protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 4 [detail] 7467540
4.2 LOC7491157 BEL1-like homeodomain protein 3 [detail] 7491157
4.1 LOC7468990 uncharacterized LOC7468990 [detail] 7468990
4.0 LOC7458945 regulatory protein NPR5 [detail] 7458945
3.6 LOC7497015 G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g27290 [detail] 7497015
3.1 LOC7479057 cilia- and flagella-associated protein 58 [detail] 7479057
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for LOC7487181]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 7487181    
Refseq ID (protein) XP_002325335.2 


The preparation time of this page was 0.2 [sec].