[][] gma   GLYMA_03G164000 Gene
functional annotation
Function   protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 4
GO BP
GO CC
GO MF
KEGG
Protein XP_006576945.1 
BLAST XP_006576945.1 
Orthologous [Ortholog page] LSH3 (ath)LSH10 (ath)LSH2 (ath)LSH4 (ath)LSH1 (ath)LSH6 (ath)LSH8 (ath)LSH7 (ath)LOC4330024 (osa)LOC4331099 (osa)LOC4336401 (osa)LOC4338491 (osa)LOC7454352 (ppo)LOC7455945 (ppo)LOC7467540 (ppo)LOC7471962 (ppo)LOC7474992 (ppo)LOC7487181 (ppo)LOC7487704 (ppo)LOC7489106 (ppo)LOC9266624 (osa)LOC11407427 (mtr)LOC11408401 (mtr)LOC11408456 (mtr)LOC11409774 (mtr)LOC11410018 (mtr)LOC11410358 (mtr)LOC11419093 (mtr)LOC11434608 (mtr)LOC25484251 (mtr)LOC25485780 (mtr)LOC25485963 (mtr)LOC25499270 (mtr)LOC25499718 (mtr)LSH5 (ath)LOC100192901 (zma)LOC100217086 (zma)LOC100244642 (vvi)LOC100249172 (vvi)LOC100254926 (vvi)LOC100257253 (vvi)LOC100260366 (vvi)LOC100265705 (vvi)LOC100266079 (vvi)LOC100274783 (zma)LOC100275232 (zma)LOC100276429 (zma)LOC100278049 (zma)LOC100278742 (zma)LOC100304411 (zma)LOC100306082 (gma)LOC100306225 (gma)LOC100527164 (gma)LOC100527409 (gma)LOC100527554 (gma)LOC100778886 (gma)LOC100780494 (gma)LOC100786135 (gma)LOC100789834 (gma)LOC100791424 (gma)LOC100802715 (gma)LOC100802937 (gma)LOC100803605 (gma)LOC100803965 (gma)LOC100806134 (gma)LOC100806493 (gma)LOC100806497 (gma)LOC100810655 (gma)LOC100815968 (gma)TFAM1 (sly)LOC101246185 (sly)LOC101247206 (sly)TFAM2 (sly)LOC101252299 (sly)LOC101253723 (sly)LOC101256738 (sly)LOC101260873 (sly)LOC101261831 (sly)LOC101262247 (sly)LOC101263979 (sly)LOC102663941 (gma)LOC103636537 (zma)LOC103651051 (zma)LOC103828755 (bra)LOC103832357 (bra)LOC103833736 (bra)LOC103837296 (bra)LOC103843480 (bra)LOC103843985 (bra)LOC103845277 (bra)LOC103848911 (bra)LOC103851635 (bra)LOC103853147 (bra)LOC103854635 (bra)LOC103858024 (bra)LOC103859037 (bra)LOC103865110 (bra)LOC103865960 (bra)LOC103866652 (bra)LOC103867894 (bra)LOC103867981 (bra)LOC103874577 (bra)LOC104879291 (vvi)LOC107276238 (osa)LOC107278610 (osa)
Subcellular
localization
wolf
nucl 9  (predict for XP_006576945.1)
Subcellular
localization
TargetP
chlo 7,  other 5  (predict for XP_006576945.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
gma04075 Plant hormone signal transduction 2
Genes directly connected with LOC100778283 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail
Entrez Gene ID*
7.4 LOC100527164 uncharacterized LOC100527164 [detail] 100527164
6.0 LOC100789834 protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 4 [detail] 100789834
5.0 LOC100798496 BEL1-like homeodomain protein 9 [detail] 100798496
4.6 LOC100783294 regulatory protein NPR5 [detail] 100783294
4.5 LOC100806497 protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 4 [detail] 100806497
4.3 LOC100801357 uncharacterized LOC100801357 [detail] 100801357
4.2 LOC100499821 ACT domain-containing protein [detail] 100499821
3.7 LOC102663941 protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 4 [detail] 102663941
3.6 LOC100784812 F-box/kelch-repeat protein SKIP4 [detail] 100784812
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for LOC100778283]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 100778283    
Refseq ID (protein) XP_006576945.1 


The preparation time of this page was 0.2 [sec].