[][] mtr   MTR_2g016110 Gene
functional annotation
Function   protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 10
GO BP
GO CC
GO MF
KEGG
Protein XP_013462558.1 
BLAST XP_013462558.1 
Orthologous [Ortholog page] LSH3 (ath)LSH10 (ath)LSH2 (ath)LSH4 (ath)LSH1 (ath)LSH6 (ath)LSH8 (ath)LSH7 (ath)LOC4330024 (osa)LOC4331099 (osa)LOC4336401 (osa)LOC4338491 (osa)LOC7454352 (ppo)LOC7455945 (ppo)LOC7467540 (ppo)LOC7471962 (ppo)LOC7474992 (ppo)LOC7487181 (ppo)LOC7487704 (ppo)LOC7489106 (ppo)LOC9266624 (osa)LOC11407427 (mtr)LOC11408401 (mtr)LOC11408456 (mtr)LOC11409774 (mtr)LOC11410018 (mtr)LOC11410358 (mtr)LOC11419093 (mtr)LOC11434608 (mtr)LOC25484251 (mtr)LOC25485780 (mtr)LOC25499270 (mtr)LOC25499718 (mtr)LSH5 (ath)LOC100192901 (zma)LOC100217086 (zma)LOC100244642 (vvi)LOC100249172 (vvi)LOC100254926 (vvi)LOC100257253 (vvi)LOC100260366 (vvi)LOC100265705 (vvi)LOC100266079 (vvi)LOC100274783 (zma)LOC100275232 (zma)LOC100276429 (zma)LOC100278049 (zma)LOC100278742 (zma)LOC100304411 (zma)LOC100306082 (gma)LOC100306225 (gma)LOC100527164 (gma)LOC100527409 (gma)LOC100527554 (gma)LOC100778283 (gma)LOC100778886 (gma)LOC100780494 (gma)LOC100786135 (gma)LOC100789834 (gma)LOC100791424 (gma)LOC100802715 (gma)LOC100802937 (gma)LOC100803605 (gma)LOC100803965 (gma)LOC100806134 (gma)LOC100806493 (gma)LOC100806497 (gma)LOC100810655 (gma)LOC100815968 (gma)TFAM1 (sly)LOC101246185 (sly)LOC101247206 (sly)TFAM2 (sly)LOC101252299 (sly)LOC101253723 (sly)LOC101256738 (sly)LOC101260873 (sly)LOC101261831 (sly)LOC101262247 (sly)LOC101263979 (sly)LOC102663941 (gma)LOC103636537 (zma)LOC103651051 (zma)LOC103828755 (bra)LOC103832357 (bra)LOC103833736 (bra)LOC103837296 (bra)LOC103843480 (bra)LOC103843985 (bra)LOC103845277 (bra)LOC103848911 (bra)LOC103851635 (bra)LOC103853147 (bra)LOC103854635 (bra)LOC103858024 (bra)LOC103859037 (bra)LOC103865110 (bra)LOC103865960 (bra)LOC103866652 (bra)LOC103867894 (bra)LOC103867981 (bra)LOC103874577 (bra)LOC104879291 (vvi)LOC107276238 (osa)LOC107278610 (osa)
Subcellular
localization
wolf
nucl 9  (predict for XP_013462558.1)
Subcellular
localization
TargetP
chlo 8,  other 3  (predict for XP_013462558.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with LOC25485963 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail
Entrez Gene ID*
5.8 LOC25483249 protein trichome birefringence-like 36 [detail] 25483249
5.5 LOC11428033 WUSCHEL-related homeobox 4 [detail] 11428033
5.3 LOC11431417 uncharacterized LOC11431417 [detail] 11431417
5.1 LOC11410358 protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 10 [detail] 11410358
4.8 LOC25493337 protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 4 [detail] 25493337
4.7 LOC25486467 TMV resistance protein N [detail] 25486467
4.7 LOC25499771 uncharacterized protein At4g00950 [detail] 25499771
3.5 LOC112416316 uncharacterized LOC112416316 [detail] 112416316
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for LOC25485963]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 25485963    
Refseq ID (protein) XP_013462558.1 


The preparation time of this page was 0.2 [sec].