[][] mtr   MTR_1g080210 Gene
functional annotation
Function   protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 2
GO BP
GO CC
GO MF
KEGG
Protein XP_003590966.2 
BLAST XP_003590966.2 
Orthologous [Ortholog page] LSH3 (ath)LSH10 (ath)LSH2 (ath)LSH4 (ath)LSH1 (ath)LSH6 (ath)LSH8 (ath)LSH7 (ath)LOC4330024 (osa)LOC4331099 (osa)LOC4336401 (osa)LOC4338491 (osa)LOC7454352 (ppo)LOC7455945 (ppo)LOC7467540 (ppo)LOC7471962 (ppo)LOC7474992 (ppo)LOC7487181 (ppo)LOC7487704 (ppo)LOC7489106 (ppo)LOC9266624 (osa)LOC11407427 (mtr)LOC11408401 (mtr)LOC11408456 (mtr)LOC11409774 (mtr)LOC11410358 (mtr)LOC11419093 (mtr)LOC11434608 (mtr)LOC25484251 (mtr)LOC25485780 (mtr)LOC25485963 (mtr)LOC25499270 (mtr)LOC25499718 (mtr)LSH5 (ath)LOC100192901 (zma)LOC100217086 (zma)LOC100244642 (vvi)LOC100249172 (vvi)LOC100254926 (vvi)LOC100257253 (vvi)LOC100260366 (vvi)LOC100265705 (vvi)LOC100266079 (vvi)LOC100274783 (zma)LOC100275232 (zma)LOC100276429 (zma)LOC100278049 (zma)LOC100278742 (zma)LOC100304411 (zma)LOC100306082 (gma)LOC100306225 (gma)LOC100527164 (gma)LOC100527409 (gma)LOC100527554 (gma)LOC100778283 (gma)LOC100778886 (gma)LOC100780494 (gma)LOC100786135 (gma)LOC100789834 (gma)LOC100791424 (gma)LOC100802715 (gma)LOC100802937 (gma)LOC100803605 (gma)LOC100803965 (gma)LOC100806134 (gma)LOC100806493 (gma)LOC100806497 (gma)LOC100810655 (gma)LOC100815968 (gma)TFAM1 (sly)LOC101246185 (sly)LOC101247206 (sly)TFAM2 (sly)LOC101252299 (sly)LOC101253723 (sly)LOC101256738 (sly)LOC101260873 (sly)LOC101261831 (sly)LOC101262247 (sly)LOC101263979 (sly)LOC102663941 (gma)LOC103636537 (zma)LOC103651051 (zma)LOC103828755 (bra)LOC103832357 (bra)LOC103833736 (bra)LOC103837296 (bra)LOC103843480 (bra)LOC103843985 (bra)LOC103845277 (bra)LOC103848911 (bra)LOC103851635 (bra)LOC103853147 (bra)LOC103854635 (bra)LOC103858024 (bra)LOC103859037 (bra)LOC103865110 (bra)LOC103865960 (bra)LOC103866652 (bra)LOC103867894 (bra)LOC103867981 (bra)LOC103874577 (bra)LOC104879291 (vvi)LOC107276238 (osa)LOC107278610 (osa)
Subcellular
localization
wolf
nucl 10  (predict for XP_003590966.2)
Subcellular
localization
TargetP
chlo 9,  other 3  (predict for XP_003590966.2)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
mtr01230 Biosynthesis of amino acids 2
Genes directly connected with LOC11410018 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail
Entrez Gene ID*
4.8 LOC11419138 argininosuccinate synthase, chloroplastic [detail] 11419138
4.7 LOC11405725 G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase CES101 [detail] 11405725
4.6 LOC11407615 serine/threonine-protein kinase Nek5 [detail] 11407615
4.5 LOC11414505 WAT1-related protein At1g43650 [detail] 11414505
4.5 LOC25487971 aquaporin NIP6-1 [detail] 25487971
3.8 LOC11417107 arginine decarboxylase [detail] 11417107
3.5 LOC25500182 2-alkenal reductase (NADP(+)-dependent) [detail] 25500182
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for LOC11410018]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 11410018    
Refseq ID (protein) XP_003590966.2 


The preparation time of this page was 0.2 [sec].