[][] mtr   MTR_2g076400 Gene
functional annotation
Function   protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 7
GO BP
GO CC
GO MF
KEGG
Protein XP_003596364.1 
BLAST XP_003596364.1 
Orthologous [Ortholog page] LSH3 (ath)LSH10 (ath)LSH2 (ath)LSH4 (ath)LSH1 (ath)LSH6 (ath)LSH8 (ath)LSH7 (ath)LOC4330024 (osa)LOC4331099 (osa)LOC4336401 (osa)LOC4338491 (osa)LOC7454352 (ppo)LOC7455945 (ppo)LOC7467540 (ppo)LOC7471962 (ppo)LOC7474992 (ppo)LOC7487181 (ppo)LOC7487704 (ppo)LOC7489106 (ppo)LOC9266624 (osa)LOC11407427 (mtr)LOC11408456 (mtr)LOC11409774 (mtr)LOC11410018 (mtr)LOC11410358 (mtr)LOC11419093 (mtr)LOC11434608 (mtr)LOC25484251 (mtr)LOC25485780 (mtr)LOC25485963 (mtr)LOC25499270 (mtr)LOC25499718 (mtr)LSH5 (ath)LOC100192901 (zma)LOC100217086 (zma)LOC100244642 (vvi)LOC100249172 (vvi)LOC100254926 (vvi)LOC100257253 (vvi)LOC100260366 (vvi)LOC100265705 (vvi)LOC100266079 (vvi)LOC100274783 (zma)LOC100275232 (zma)LOC100276429 (zma)LOC100278049 (zma)LOC100278742 (zma)LOC100304411 (zma)LOC100306082 (gma)LOC100306225 (gma)LOC100527164 (gma)LOC100527409 (gma)LOC100527554 (gma)LOC100778283 (gma)LOC100778886 (gma)LOC100780494 (gma)LOC100786135 (gma)LOC100789834 (gma)LOC100791424 (gma)LOC100802715 (gma)LOC100802937 (gma)LOC100803605 (gma)LOC100803965 (gma)LOC100806134 (gma)LOC100806493 (gma)LOC100806497 (gma)LOC100810655 (gma)LOC100815968 (gma)TFAM1 (sly)LOC101246185 (sly)LOC101247206 (sly)TFAM2 (sly)LOC101252299 (sly)LOC101253723 (sly)LOC101256738 (sly)LOC101260873 (sly)LOC101261831 (sly)LOC101262247 (sly)LOC101263979 (sly)LOC102663941 (gma)LOC103636537 (zma)LOC103651051 (zma)LOC103828755 (bra)LOC103832357 (bra)LOC103833736 (bra)LOC103837296 (bra)LOC103843480 (bra)LOC103843985 (bra)LOC103845277 (bra)LOC103848911 (bra)LOC103851635 (bra)LOC103853147 (bra)LOC103854635 (bra)LOC103858024 (bra)LOC103859037 (bra)LOC103865110 (bra)LOC103865960 (bra)LOC103866652 (bra)LOC103867894 (bra)LOC103867981 (bra)LOC103874577 (bra)LOC104879291 (vvi)LOC107276238 (osa)LOC107278610 (osa)
Subcellular
localization
wolf
nucl 9,  cyto 1,  mito 1  (predict for XP_003596364.1)
Subcellular
localization
TargetP
other 8  (predict for XP_003596364.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
mtr00940 Phenylpropanoid biosynthesis 2
Genes directly connected with LOC11408401 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail
Entrez Gene ID*
4.9 LOC11431417 uncharacterized LOC11431417 [detail] 11431417
4.4 LOC11424137 peroxidase 51 [detail] 11424137
4.4 LOC11443583 protein DETOXIFICATION 46, chloroplastic [detail] 11443583
4.2 LOC11407534 uncharacterized LOC11407534 [detail] 11407534
3.9 LOC11405516 uncharacterized LOC11405516 [detail] 11405516
3.8 LOC11406968 uncharacterized LOC11406968 [detail] 11406968
3.7 LOC25496084 vacuolar iron transporter homolog 1 [detail] 25496084
3.6 LOC25502686 amino acid transporter AVT1I [detail] 25502686
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for LOC11408401]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 11408401    
Refseq ID (protein) XP_003596364.1 


The preparation time of this page was 0.2 [sec].