[←][→] ppo   POPTR_011G156600v3 Gene
functional annotation
Function   protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 4  
GO BP
GO CC
GO MF
KEGG
Protein XP_002317078.1 
BLAST XP_002317078.1 
Orthologous [Ortholog page] LSH3 (ath)  LSH10 (ath)  LSH2 (ath)  LSH4 (ath)  LSH1 (ath)  LSH6 (ath)  LSH8 (ath)  LSH7 (ath)  LOC4330024 (osa)  LOC4331099 (osa)  LOC4336401 (osa)  LOC4338491 (osa)  LOC7454352 (ppo)  LOC7455945 (ppo)  LOC7467540 (ppo)  LOC7471962 (ppo)  LOC7474992 (ppo)  LOC7487181 (ppo)  LOC7487704 (ppo)  LOC9266624 (osa)  LOC11407427 (mtr)  LOC11408401 (mtr)  LOC11408456 (mtr)  LOC11409774 (mtr)  LOC11410018 (mtr)  LOC11410358 (mtr)  LOC11419093 (mtr)  LOC11434608 (mtr)  LOC25484251 (mtr)  LOC25485780 (mtr)  LOC25485963 (mtr)  LOC25499270 (mtr)  LOC25499718 (mtr)  LSH5 (ath)  LOC100192901 (zma)  LOC100217086 (zma)  LOC100244642 (vvi)  LOC100249172 (vvi)  LOC100254926 (vvi)  LOC100257253 (vvi)  LOC100260366 (vvi)  LOC100265705 (vvi)  LOC100266079 (vvi)  LOC100274783 (zma)  LOC100275232 (zma)  LOC100276429 (zma)  LOC100278049 (zma)  LOC100278742 (zma)  LOC100304411 (zma)  LOC100306082 (gma)  LOC100306225 (gma)  LOC100527164 (gma)  LOC100527409 (gma)  LOC100527554 (gma)  LOC100778283 (gma)  LOC100778886 (gma)  LOC100780494 (gma)  LOC100786135 (gma)  LOC100789834 (gma)  LOC100791424 (gma)  LOC100802715 (gma)  LOC100802937 (gma)  LOC100803605 (gma)  LOC100803965 (gma)  LOC100806134 (gma)  LOC100806493 (gma)  LOC100806497 (gma)  LOC100810655 (gma)  LOC100815968 (gma)  TFAM1 (sly)  LOC101246185 (sly)  LOC101247206 (sly)  TFAM2 (sly)  LOC101252299 (sly)  LOC101253723 (sly)  LOC101256738 (sly)  LOC101260873 (sly)  LOC101261831 (sly)  LOC101262247 (sly)  LOC101263979 (sly)  LOC102663941 (gma)  LOC103636537 (zma)  LOC103651051 (zma)  LOC103828755 (bra)  LOC103832357 (bra)  LOC103833736 (bra)  LOC103837296 (bra)  LOC103843480 (bra)  LOC103843985 (bra)  LOC103845277 (bra)  LOC103848911 (bra)  LOC103851635 (bra)  LOC103853147 (bra)  LOC103854635 (bra)  LOC103858024 (bra)  LOC103859037 (bra)  LOC103865110 (bra)  LOC103865960 (bra)  LOC103866652 (bra)  LOC103867894 (bra)  LOC103867981 (bra)  LOC103874577 (bra)  LOC104879291 (vvi)  LOC107276238 (osa)  LOC107278610 (osa) 
Subcellular
localization
wolf
chlo 9,  nucl 1  (predict for XP_002317078.1)
Subcellular
localization
TargetP
chlo 9  (predict for XP_002317078.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
KEGG* ID Title #genes Link to the KEGG* map
(Multiple genes)
ppo04120 Ubiquitin mediated proteolysis 2
ppo00240 Pyrimidine metabolism 2
Genes directly connected with LOC7489106 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail		 Entrez Gene ID*
3.5 LOC7454352 protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 4 [detail] 7454352
3.2 LOC7468865 14-3-3-like protein B [detail] 7468865
3.1 LOC7488587 dCTP pyrophosphatase 1 [detail] 7488587
Coexpressed
gene list		 [Coexpressed gene list for LOC7489106]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 7489106      
Refseq ID (protein) XP_002317078.1 


The preparation time of this page was 0.1 [sec].