[][] gma   GLYMA_13G229700 Gene
functional annotation
Function   protein LIGHT-DEPENDENT SHORT HYPOCOTYLS 10
GO BP
GO CC
GO MF
KEGG
Protein XP_003542999.1 
BLAST XP_003542999.1 
Orthologous [Ortholog page] LSH3 (ath)LSH10 (ath)LSH2 (ath)LSH4 (ath)LSH1 (ath)LSH6 (ath)LSH8 (ath)LSH7 (ath)LOC4330024 (osa)LOC4331099 (osa)LOC4336401 (osa)LOC4338491 (osa)LOC7454352 (ppo)LOC7455945 (ppo)LOC7467540 (ppo)LOC7471962 (ppo)LOC7474992 (ppo)LOC7487181 (ppo)LOC7487704 (ppo)LOC7489106 (ppo)LOC9266624 (osa)LOC11407427 (mtr)LOC11408401 (mtr)LOC11408456 (mtr)LOC11409774 (mtr)LOC11410018 (mtr)LOC11410358 (mtr)LOC11419093 (mtr)LOC11434608 (mtr)LOC25484251 (mtr)LOC25485780 (mtr)LOC25485963 (mtr)LOC25499270 (mtr)LOC25499718 (mtr)LSH5 (ath)LOC100192901 (zma)LOC100217086 (zma)LOC100244642 (vvi)LOC100249172 (vvi)LOC100254926 (vvi)LOC100257253 (vvi)LOC100260366 (vvi)LOC100265705 (vvi)LOC100266079 (vvi)LOC100274783 (zma)LOC100275232 (zma)LOC100276429 (zma)LOC100278049 (zma)LOC100278742 (zma)LOC100304411 (zma)LOC100306082 (gma)LOC100306225 (gma)LOC100527164 (gma)LOC100527409 (gma)LOC100527554 (gma)LOC100778283 (gma)LOC100780494 (gma)LOC100786135 (gma)LOC100789834 (gma)LOC100791424 (gma)LOC100802715 (gma)LOC100802937 (gma)LOC100803605 (gma)LOC100803965 (gma)LOC100806134 (gma)LOC100806493 (gma)LOC100806497 (gma)LOC100810655 (gma)LOC100815968 (gma)TFAM1 (sly)LOC101246185 (sly)LOC101247206 (sly)TFAM2 (sly)LOC101252299 (sly)LOC101253723 (sly)LOC101256738 (sly)LOC101260873 (sly)LOC101261831 (sly)LOC101262247 (sly)LOC101263979 (sly)LOC102663941 (gma)LOC103636537 (zma)LOC103651051 (zma)LOC103828755 (bra)LOC103832357 (bra)LOC103833736 (bra)LOC103837296 (bra)LOC103843480 (bra)LOC103843985 (bra)LOC103845277 (bra)LOC103848911 (bra)LOC103851635 (bra)LOC103853147 (bra)LOC103854635 (bra)LOC103858024 (bra)LOC103859037 (bra)LOC103865110 (bra)LOC103865960 (bra)LOC103866652 (bra)LOC103867894 (bra)LOC103867981 (bra)LOC103874577 (bra)LOC104879291 (vvi)LOC107276238 (osa)LOC107278610 (osa)
Subcellular
localization
wolf
nucl 8,  mito 1  (predict for XP_003542999.1)
Subcellular
localization
TargetP
chlo 6,  other 4  (predict for XP_003542999.1)
Gene coexpression
Network*for
coexpressed
genes
LCNloc
[Cytoscape]
Genes directly connected with LOC100778886 on the network
coex z* Locus Function* Coexpression
detail
Entrez Gene ID*
7.0 LOC100306082 uncharacterized LOC100306082 [detail] 100306082
5.0 LOC100799062 sodium/calcium exchanger NCL2 [detail] 100799062
4.7 LOC100810808 protein SHORT-ROOT [detail] 100810808
Coexpressed
gene list
[Coexpressed gene list for LOC100778886]
Gene expression
All samples [Expression pattern for all samples]
Link to other DBs
Entrez Gene ID 100778886    
Refseq ID (protein) XP_003542999.1 


The preparation time of this page was 0.2 [sec].